Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpl3P27659 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpl3P27659 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpl3P27659 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpl3P27659 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpl3P27659 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpl3P27659 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpl3P27659 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpl3P27659 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpl3P27659 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpl3P27659 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpl3P27659 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpl3P27659 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpl3P27659 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpl3P27659 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpl3P27659 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpl3P27659 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpl3P27659 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpl3P27659 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpl3P27659 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpl3P27659 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpl3P27659 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rpl3P27659 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rpl3P27659 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rpl3P27659 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpl3P27659 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpl3P27659 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpl3P27659 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpl3P27659 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpl3P27659 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpl3P27659 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpl3P27659 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpl3P27659 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpl3P27659 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpl3P27659 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpl3P27659 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpl3P27659 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpl3P27659 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpl3P27659 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpl3P27659 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rpl3P27659 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpl3P27659 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpl3P27659 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpl3P27659 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpl3P27659 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpl3P27659 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpl3P27659 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpl3P27659 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpl3P27659 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpl3P27659 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpl3P27659 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpl3P27659 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpl3P27659 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpl3P27659 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpl3P27659 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpl3P27659 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpl3P27659 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpl3P27659 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpl3P27659 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpl3P27659 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpl3P27659 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpl3P27659 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpl3P27659 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpl3P27659 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpl3P27659 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpl3P27659 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpl3P27659 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpl3P27659 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpl3P27659 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpl3P27659 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpl3P27659 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpl3P27659 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpl3P27659 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpl3P27659 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpl3P27659 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpl3P27659 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpl3P27659 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpl3P27659 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpl3P27659 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpl3P27659 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpl3P27659 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rpl3P27659 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rpl3P27659 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rpl3P27659 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpl3P27659 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpl3P27659 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpl3P27659 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpl3P27659 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpl3P27659 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpl3P27659 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpl3P27659 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpl3P27659 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpl3P27659 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpl3P27659 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpl3P27659 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpl3P27659 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpl3P27659 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpl3P27659 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpl3P27659 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpl3P27659 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms