Protein–RNA interactions for Protein: P21275

Bmp4, Bone morphogenetic protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp4P21275 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Bmp4P21275 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bmp4P21275 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bmp4P21275 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bmp4P21275 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bmp4P21275 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bmp4P21275 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bmp4P21275 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bmp4P21275 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bmp4P21275 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bmp4P21275 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Bmp4P21275 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Bmp4P21275 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Bmp4P21275 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Bmp4P21275 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bmp4P21275 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bmp4P21275 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bmp4P21275 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bmp4P21275 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bmp4P21275 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bmp4P21275 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Bmp4P21275 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Bmp4P21275 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Bmp4P21275 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Bmp4P21275 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Bmp4P21275 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bmp4P21275 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bmp4P21275 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bmp4P21275 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Bmp4P21275 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bmp4P21275 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bmp4P21275 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bmp4P21275 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bmp4P21275 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bmp4P21275 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bmp4P21275 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bmp4P21275 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Bmp4P21275 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bmp4P21275 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bmp4P21275 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bmp4P21275 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bmp4P21275 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bmp4P21275 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bmp4P21275 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bmp4P21275 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bmp4P21275 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bmp4P21275 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bmp4P21275 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bmp4P21275 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bmp4P21275 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bmp4P21275 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Bmp4P21275 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bmp4P21275 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bmp4P21275 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bmp4P21275 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bmp4P21275 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bmp4P21275 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bmp4P21275 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bmp4P21275 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bmp4P21275 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bmp4P21275 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bmp4P21275 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bmp4P21275 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bmp4P21275 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bmp4P21275 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bmp4P21275 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bmp4P21275 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bmp4P21275 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bmp4P21275 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bmp4P21275 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bmp4P21275 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bmp4P21275 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bmp4P21275 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bmp4P21275 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Bmp4P21275 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bmp4P21275 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bmp4P21275 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bmp4P21275 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bmp4P21275 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bmp4P21275 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bmp4P21275 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bmp4P21275 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bmp4P21275 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bmp4P21275 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Bmp4P21275 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bmp4P21275 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bmp4P21275 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bmp4P21275 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Bmp4P21275 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bmp4P21275 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bmp4P21275 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bmp4P21275 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bmp4P21275 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bmp4P21275 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Bmp4P21275 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Bmp4P21275 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bmp4P21275 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bmp4P21275 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Bmp4P21275 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bmp4P21275 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms