Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Prim1P20664 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Prim1P20664 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Prim1P20664 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Prim1P20664 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Prim1P20664 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Prim1P20664 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Prim1P20664 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Prim1P20664 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Prim1P20664 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Prim1P20664 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Prim1P20664 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Prim1P20664 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Prim1P20664 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Prim1P20664 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Prim1P20664 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Prim1P20664 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Prim1P20664 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Prim1P20664 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Prim1P20664 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Prim1P20664 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Prim1P20664 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Prim1P20664 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Prim1P20664 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Prim1P20664 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Prim1P20664 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Prim1P20664 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Prim1P20664 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Prim1P20664 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Prim1P20664 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Prim1P20664 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Prim1P20664 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Prim1P20664 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Prim1P20664 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Prim1P20664 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Prim1P20664 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Prim1P20664 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Prim1P20664 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Prim1P20664 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Prim1P20664 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Prim1P20664 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Prim1P20664 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Prim1P20664 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Prim1P20664 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Prim1P20664 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Prim1P20664 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Prim1P20664 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Prim1P20664 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Prim1P20664 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Prim1P20664 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Prim1P20664 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Prim1P20664 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Prim1P20664 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Prim1P20664 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Prim1P20664 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Prim1P20664 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Prim1P20664 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Prim1P20664 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Prim1P20664 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Prim1P20664 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Prim1P20664 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Prim1P20664 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Prim1P20664 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Prim1P20664 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
Prim1P20664 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Prim1P20664 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Prim1P20664 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Prim1P20664 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Prim1P20664 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Prim1P20664 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Prim1P20664 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Prim1P20664 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Prim1P20664 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
Prim1P20664 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Prim1P20664 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Prim1P20664 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Prim1P20664 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Prim1P20664 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Prim1P20664 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Prim1P20664 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Prim1P20664 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Prim1P20664 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Prim1P20664 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Prim1P20664 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Prim1P20664 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Prim1P20664 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Prim1P20664 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Prim1P20664 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Prim1P20664 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Prim1P20664 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Prim1P20664 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Prim1P20664 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Prim1P20664 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Prim1P20664 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Prim1P20664 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Prim1P20664 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Prim1P20664 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Prim1P20664 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Prim1P20664 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Prim1P20664 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms