Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrkcaP20444 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkcaP20444 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkcaP20444 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkcaP20444 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkcaP20444 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkcaP20444 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkcaP20444 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkcaP20444 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkcaP20444 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkcaP20444 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrkcaP20444 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrkcaP20444 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrkcaP20444 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrkcaP20444 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrkcaP20444 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkcaP20444 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkcaP20444 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkcaP20444 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkcaP20444 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkcaP20444 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PrkcaP20444 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrkcaP20444 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrkcaP20444 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkcaP20444 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkcaP20444 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkcaP20444 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkcaP20444 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkcaP20444 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkcaP20444 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkcaP20444 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkcaP20444 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrkcaP20444 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkcaP20444 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkcaP20444 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkcaP20444 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkcaP20444 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PrkcaP20444 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrkcaP20444 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrkcaP20444 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrkcaP20444 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrkcaP20444 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrkcaP20444 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrkcaP20444 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrkcaP20444 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrkcaP20444 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrkcaP20444 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrkcaP20444 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrkcaP20444 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkcaP20444 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkcaP20444 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrkcaP20444 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrkcaP20444 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrkcaP20444 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrkcaP20444 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrkcaP20444 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrkcaP20444 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkcaP20444 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkcaP20444 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkcaP20444 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkcaP20444 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkcaP20444 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkcaP20444 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkcaP20444 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrkcaP20444 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrkcaP20444 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrkcaP20444 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrkcaP20444 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrkcaP20444 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkcaP20444 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PrkcaP20444 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkcaP20444 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkcaP20444 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkcaP20444 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkcaP20444 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrkcaP20444 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrkcaP20444 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrkcaP20444 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrkcaP20444 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrkcaP20444 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrkcaP20444 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrkcaP20444 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrkcaP20444 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrkcaP20444 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrkcaP20444 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrkcaP20444 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkcaP20444 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkcaP20444 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkcaP20444 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkcaP20444 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkcaP20444 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkcaP20444 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkcaP20444 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkcaP20444 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrkcaP20444 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PrkcaP20444 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PrkcaP20444 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrkcaP20444 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrkcaP20444 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkcaP20444 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms