Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TP20293 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TP20293 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TP20293 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TP20293 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TP20293 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TP20293 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TP20293 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TP20293 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TP20293 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TP20293 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TP20293 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TP20293 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TP20293 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TP20293 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TP20293 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TP20293 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TP20293 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TP20293 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TP20293 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TP20293 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TP20293 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TP20293 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TP20293 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TP20293 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TP20293 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TP20293 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TP20293 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TP20293 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TP20293 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TP20293 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TP20293 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TP20293 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TP20293 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TP20293 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TP20293 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TP20293 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TP20293 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TP20293 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TP20293 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TP20293 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TP20293 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TP20293 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TP20293 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TP20293 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TP20293 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TP20293 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TP20293 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TP20293 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TP20293 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TP20293 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TP20293 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TP20293 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TP20293 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TP20293 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TP20293 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TP20293 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TP20293 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TP20293 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TP20293 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TP20293 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TP20293 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TP20293 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TP20293 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TP20293 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TP20293 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TP20293 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TP20293 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TP20293 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TP20293 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TP20293 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TP20293 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TP20293 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TP20293 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TP20293 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TP20293 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TP20293 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TP20293 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TP20293 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TP20293 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TP20293 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TP20293 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TP20293 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TP20293 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TP20293 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TP20293 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TP20293 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TP20293 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TP20293 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TP20293 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TP20293 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TP20293 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TP20293 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TP20293 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TP20293 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TP20293 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TP20293 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TP20293 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TP20293 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TP20293 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms