Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PcnaP17918 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PcnaP17918 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PcnaP17918 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PcnaP17918 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PcnaP17918 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PcnaP17918 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PcnaP17918 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PcnaP17918 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PcnaP17918 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PcnaP17918 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PcnaP17918 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PcnaP17918 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PcnaP17918 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PcnaP17918 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PcnaP17918 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PcnaP17918 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PcnaP17918 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PcnaP17918 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PcnaP17918 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PcnaP17918 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PcnaP17918 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PcnaP17918 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PcnaP17918 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PcnaP17918 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PcnaP17918 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PcnaP17918 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PcnaP17918 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PcnaP17918 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PcnaP17918 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PcnaP17918 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PcnaP17918 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PcnaP17918 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PcnaP17918 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PcnaP17918 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PcnaP17918 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PcnaP17918 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PcnaP17918 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PcnaP17918 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PcnaP17918 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PcnaP17918 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PcnaP17918 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PcnaP17918 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PcnaP17918 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PcnaP17918 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PcnaP17918 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PcnaP17918 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PcnaP17918 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PcnaP17918 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PcnaP17918 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PcnaP17918 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PcnaP17918 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PcnaP17918 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PcnaP17918 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PcnaP17918 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PcnaP17918 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PcnaP17918 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PcnaP17918 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PcnaP17918 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PcnaP17918 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PcnaP17918 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PcnaP17918 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PcnaP17918 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PcnaP17918 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PcnaP17918 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PcnaP17918 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PcnaP17918 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PcnaP17918 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PcnaP17918 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PcnaP17918 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PcnaP17918 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PcnaP17918 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PcnaP17918 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PcnaP17918 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PcnaP17918 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PcnaP17918 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PcnaP17918 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PcnaP17918 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PcnaP17918 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PcnaP17918 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PcnaP17918 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PcnaP17918 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PcnaP17918 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PcnaP17918 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PcnaP17918 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PcnaP17918 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PcnaP17918 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PcnaP17918 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PcnaP17918 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PcnaP17918 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PcnaP17918 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PcnaP17918 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PcnaP17918 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PcnaP17918 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PcnaP17918 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PcnaP17918 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PcnaP17918 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PcnaP17918 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PcnaP17918 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PcnaP17918 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms