Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Usp53P15975 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Usp53P15975 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Usp53P15975 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Usp53P15975 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Usp53P15975 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Usp53P15975 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Usp53P15975 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Usp53P15975 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Usp53P15975 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Usp53P15975 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Usp53P15975 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Usp53P15975 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Usp53P15975 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Usp53P15975 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Usp53P15975 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Usp53P15975 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Usp53P15975 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Usp53P15975 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Usp53P15975 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Usp53P15975 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Usp53P15975 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Usp53P15975 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Usp53P15975 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Usp53P15975 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Usp53P15975 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Usp53P15975 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Usp53P15975 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Usp53P15975 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Usp53P15975 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Usp53P15975 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Usp53P15975 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Usp53P15975 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Usp53P15975 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Usp53P15975 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Usp53P15975 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Usp53P15975 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Usp53P15975 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Usp53P15975 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Usp53P15975 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Usp53P15975 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Usp53P15975 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Usp53P15975 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Usp53P15975 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Usp53P15975 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Usp53P15975 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Usp53P15975 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Usp53P15975 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Usp53P15975 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Usp53P15975 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Usp53P15975 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Usp53P15975 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Usp53P15975 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Usp53P15975 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Usp53P15975 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Usp53P15975 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Usp53P15975 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Usp53P15975 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Usp53P15975 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Usp53P15975 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Usp53P15975 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Usp53P15975 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Usp53P15975 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Usp53P15975 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Usp53P15975 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Usp53P15975 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Usp53P15975 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Usp53P15975 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Usp53P15975 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Usp53P15975 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Usp53P15975 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Usp53P15975 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Usp53P15975 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp53P15975 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Usp53P15975 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Usp53P15975 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Usp53P15975 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Usp53P15975 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Usp53P15975 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Usp53P15975 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Usp53P15975 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Usp53P15975 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Usp53P15975 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Usp53P15975 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Usp53P15975 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Usp53P15975 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Usp53P15975 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Usp53P15975 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Usp53P15975 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Usp53P15975 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Usp53P15975 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Usp53P15975 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Usp53P15975 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Usp53P15975 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Usp53P15975 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Usp53P15975 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Usp53P15975 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Usp53P15975 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Usp53P15975 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Usp53P15975 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 221.7 ms