Protein–RNA interactions for Protein: P13405

Rb1, Retinoblastoma-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1P13405 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rb1P13405 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rb1P13405 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rb1P13405 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rb1P13405 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rb1P13405 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rb1P13405 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rb1P13405 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rb1P13405 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Rb1P13405 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rb1P13405 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rb1P13405 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rb1P13405 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Rb1P13405 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rb1P13405 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rb1P13405 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rb1P13405 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rb1P13405 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rb1P13405 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rb1P13405 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rb1P13405 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rb1P13405 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rb1P13405 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rb1P13405 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rb1P13405 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rb1P13405 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rb1P13405 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rb1P13405 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rb1P13405 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rb1P13405 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rb1P13405 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rb1P13405 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rb1P13405 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rb1P13405 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rb1P13405 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rb1P13405 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rb1P13405 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rb1P13405 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rb1P13405 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rb1P13405 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rb1P13405 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rb1P13405 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rb1P13405 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rb1P13405 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rb1P13405 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rb1P13405 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rb1P13405 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Rb1P13405 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Rb1P13405 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rb1P13405 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rb1P13405 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rb1P13405 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rb1P13405 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rb1P13405 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rb1P13405 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rb1P13405 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rb1P13405 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rb1P13405 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rb1P13405 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rb1P13405 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rb1P13405 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rb1P13405 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rb1P13405 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rb1P13405 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rb1P13405 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rb1P13405 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Rb1P13405 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rb1P13405 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rb1P13405 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rb1P13405 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rb1P13405 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rb1P13405 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Rb1P13405 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rb1P13405 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rb1P13405 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rb1P13405 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rb1P13405 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rb1P13405 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rb1P13405 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rb1P13405 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rb1P13405 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rb1P13405 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rb1P13405 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rb1P13405 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rb1P13405 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rb1P13405 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rb1P13405 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rb1P13405 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rb1P13405 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rb1P13405 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rb1P13405 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rb1P13405 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rb1P13405 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rb1P13405 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rb1P13405 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rb1P13405 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rb1P13405 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rb1P13405 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rb1P13405 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rb1P13405 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms