Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cntn1P12960 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cntn1P12960 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cntn1P12960 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cntn1P12960 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cntn1P12960 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cntn1P12960 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cntn1P12960 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cntn1P12960 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cntn1P12960 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cntn1P12960 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cntn1P12960 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cntn1P12960 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cntn1P12960 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cntn1P12960 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cntn1P12960 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cntn1P12960 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cntn1P12960 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cntn1P12960 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cntn1P12960 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cntn1P12960 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cntn1P12960 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cntn1P12960 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cntn1P12960 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cntn1P12960 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cntn1P12960 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cntn1P12960 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cntn1P12960 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cntn1P12960 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cntn1P12960 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cntn1P12960 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cntn1P12960 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cntn1P12960 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cntn1P12960 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cntn1P12960 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Cntn1P12960 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cntn1P12960 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cntn1P12960 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cntn1P12960 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cntn1P12960 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cntn1P12960 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cntn1P12960 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cntn1P12960 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cntn1P12960 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cntn1P12960 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cntn1P12960 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cntn1P12960 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cntn1P12960 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cntn1P12960 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cntn1P12960 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cntn1P12960 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cntn1P12960 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cntn1P12960 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cntn1P12960 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cntn1P12960 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cntn1P12960 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cntn1P12960 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cntn1P12960 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cntn1P12960 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cntn1P12960 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cntn1P12960 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cntn1P12960 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntn1P12960 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntn1P12960 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cntn1P12960 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cntn1P12960 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cntn1P12960 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cntn1P12960 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cntn1P12960 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cntn1P12960 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cntn1P12960 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cntn1P12960 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cntn1P12960 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cntn1P12960 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cntn1P12960 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cntn1P12960 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cntn1P12960 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cntn1P12960 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cntn1P12960 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cntn1P12960 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cntn1P12960 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cntn1P12960 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cntn1P12960 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cntn1P12960 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cntn1P12960 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cntn1P12960 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cntn1P12960 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cntn1P12960 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cntn1P12960 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cntn1P12960 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cntn1P12960 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cntn1P12960 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cntn1P12960 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cntn1P12960 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cntn1P12960 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cntn1P12960 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cntn1P12960 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cntn1P12960 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cntn1P12960 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cntn1P12960 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms