Protein–RNA interactions for Protein: P12849

Prkar1b, cAMP-dependent protein kinase type I-beta regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkar1bP12849 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prkar1bP12849 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prkar1bP12849 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prkar1bP12849 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prkar1bP12849 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prkar1bP12849 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prkar1bP12849 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prkar1bP12849 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prkar1bP12849 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prkar1bP12849 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prkar1bP12849 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prkar1bP12849 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prkar1bP12849 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prkar1bP12849 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prkar1bP12849 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prkar1bP12849 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prkar1bP12849 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prkar1bP12849 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prkar1bP12849 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prkar1bP12849 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkar1bP12849 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkar1bP12849 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkar1bP12849 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkar1bP12849 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkar1bP12849 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prkar1bP12849 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkar1bP12849 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkar1bP12849 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkar1bP12849 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkar1bP12849 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prkar1bP12849 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prkar1bP12849 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prkar1bP12849 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Prkar1bP12849 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prkar1bP12849 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prkar1bP12849 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prkar1bP12849 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prkar1bP12849 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prkar1bP12849 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Prkar1bP12849 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prkar1bP12849 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prkar1bP12849 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prkar1bP12849 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prkar1bP12849 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prkar1bP12849 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prkar1bP12849 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prkar1bP12849 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prkar1bP12849 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prkar1bP12849 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Prkar1bP12849 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prkar1bP12849 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prkar1bP12849 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prkar1bP12849 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prkar1bP12849 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prkar1bP12849 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prkar1bP12849 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prkar1bP12849 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prkar1bP12849 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Prkar1bP12849 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prkar1bP12849 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkar1bP12849 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkar1bP12849 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkar1bP12849 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkar1bP12849 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkar1bP12849 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkar1bP12849 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkar1bP12849 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkar1bP12849 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkar1bP12849 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkar1bP12849 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkar1bP12849 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkar1bP12849 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkar1bP12849 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkar1bP12849 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prkar1bP12849 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prkar1bP12849 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkar1bP12849 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkar1bP12849 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkar1bP12849 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkar1bP12849 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkar1bP12849 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkar1bP12849 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prkar1bP12849 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prkar1bP12849 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prkar1bP12849 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prkar1bP12849 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prkar1bP12849 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prkar1bP12849 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prkar1bP12849 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prkar1bP12849 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prkar1bP12849 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prkar1bP12849 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prkar1bP12849 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prkar1bP12849 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prkar1bP12849 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prkar1bP12849 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prkar1bP12849 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prkar1bP12849 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Prkar1bP12849 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prkar1bP12849 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms