Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnp1P10856 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnp1P10856 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnp1P10856 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnp1P10856 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnp1P10856 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnp1P10856 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnp1P10856 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnp1P10856 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnp1P10856 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnp1P10856 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnp1P10856 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnp1P10856 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnp1P10856 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnp1P10856 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnp1P10856 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnp1P10856 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnp1P10856 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnp1P10856 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnp1P10856 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnp1P10856 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnp1P10856 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnp1P10856 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnp1P10856 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnp1P10856 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnp1P10856 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnp1P10856 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnp1P10856 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnp1P10856 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnp1P10856 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnp1P10856 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnp1P10856 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnp1P10856 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnp1P10856 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnp1P10856 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnp1P10856 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnp1P10856 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnp1P10856 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnp1P10856 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnp1P10856 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnp1P10856 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnp1P10856 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnp1P10856 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnp1P10856 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnp1P10856 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnp1P10856 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnp1P10856 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnp1P10856 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnp1P10856 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnp1P10856 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnp1P10856 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnp1P10856 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnp1P10856 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnp1P10856 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tnp1P10856 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnp1P10856 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnp1P10856 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnp1P10856 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnp1P10856 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnp1P10856 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnp1P10856 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnp1P10856 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnp1P10856 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnp1P10856 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnp1P10856 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnp1P10856 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnp1P10856 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnp1P10856 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnp1P10856 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnp1P10856 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnp1P10856 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnp1P10856 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnp1P10856 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnp1P10856 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnp1P10856 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnp1P10856 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnp1P10856 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnp1P10856 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnp1P10856 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnp1P10856 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnp1P10856 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnp1P10856 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnp1P10856 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnp1P10856 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnp1P10856 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnp1P10856 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnp1P10856 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnp1P10856 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnp1P10856 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnp1P10856 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnp1P10856 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnp1P10856 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnp1P10856 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnp1P10856 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnp1P10856 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnp1P10856 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnp1P10856 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnp1P10856 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnp1P10856 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnp1P10856 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms