Protein–RNA interactions for Protein: P10146

Ccl1, C-C motif chemokine 1, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl1P10146 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccl1P10146 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccl1P10146 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccl1P10146 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccl1P10146 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccl1P10146 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccl1P10146 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccl1P10146 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccl1P10146 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccl1P10146 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccl1P10146 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccl1P10146 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccl1P10146 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccl1P10146 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccl1P10146 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccl1P10146 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccl1P10146 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccl1P10146 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl1P10146 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl1P10146 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl1P10146 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl1P10146 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccl1P10146 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccl1P10146 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccl1P10146 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccl1P10146 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccl1P10146 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccl1P10146 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccl1P10146 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccl1P10146 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccl1P10146 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccl1P10146 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccl1P10146 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccl1P10146 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccl1P10146 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccl1P10146 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccl1P10146 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccl1P10146 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccl1P10146 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccl1P10146 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccl1P10146 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl1P10146 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl1P10146 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl1P10146 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl1P10146 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccl1P10146 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccl1P10146 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccl1P10146 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccl1P10146 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccl1P10146 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccl1P10146 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccl1P10146 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccl1P10146 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccl1P10146 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccl1P10146 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccl1P10146 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccl1P10146 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccl1P10146 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccl1P10146 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccl1P10146 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccl1P10146 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccl1P10146 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccl1P10146 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccl1P10146 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccl1P10146 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccl1P10146 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccl1P10146 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccl1P10146 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccl1P10146 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccl1P10146 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccl1P10146 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccl1P10146 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccl1P10146 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccl1P10146 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccl1P10146 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccl1P10146 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccl1P10146 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccl1P10146 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccl1P10146 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccl1P10146 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccl1P10146 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccl1P10146 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccl1P10146 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccl1P10146 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccl1P10146 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccl1P10146 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccl1P10146 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccl1P10146 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccl1P10146 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccl1P10146 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccl1P10146 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccl1P10146 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccl1P10146 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccl1P10146 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccl1P10146 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccl1P10146 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccl1P10146 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccl1P10146 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccl1P10146 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccl1P10146 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms