Protein–RNA interactions for Protein: P09803

Cdh1, Cadherin-1, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh1P09803 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdh1P09803 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdh1P09803 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdh1P09803 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdh1P09803 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdh1P09803 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdh1P09803 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdh1P09803 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdh1P09803 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdh1P09803 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdh1P09803 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdh1P09803 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdh1P09803 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdh1P09803 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdh1P09803 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdh1P09803 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdh1P09803 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdh1P09803 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdh1P09803 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdh1P09803 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdh1P09803 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdh1P09803 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdh1P09803 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdh1P09803 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdh1P09803 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdh1P09803 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdh1P09803 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdh1P09803 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdh1P09803 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdh1P09803 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdh1P09803 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdh1P09803 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdh1P09803 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdh1P09803 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdh1P09803 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdh1P09803 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdh1P09803 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdh1P09803 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdh1P09803 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdh1P09803 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdh1P09803 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdh1P09803 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdh1P09803 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdh1P09803 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdh1P09803 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdh1P09803 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdh1P09803 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdh1P09803 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdh1P09803 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdh1P09803 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdh1P09803 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdh1P09803 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdh1P09803 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdh1P09803 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdh1P09803 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdh1P09803 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdh1P09803 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdh1P09803 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdh1P09803 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdh1P09803 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdh1P09803 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdh1P09803 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdh1P09803 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdh1P09803 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdh1P09803 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdh1P09803 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdh1P09803 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdh1P09803 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdh1P09803 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdh1P09803 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdh1P09803 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdh1P09803 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdh1P09803 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdh1P09803 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdh1P09803 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdh1P09803 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdh1P09803 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdh1P09803 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdh1P09803 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdh1P09803 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdh1P09803 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdh1P09803 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdh1P09803 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdh1P09803 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdh1P09803 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdh1P09803 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdh1P09803 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdh1P09803 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdh1P09803 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdh1P09803 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdh1P09803 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdh1P09803 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdh1P09803 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdh1P09803 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdh1P09803 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdh1P09803 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdh1P09803 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdh1P09803 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cdh1P09803 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdh1P09803 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms