Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apoa4P06728 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apoa4P06728 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apoa4P06728 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apoa4P06728 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apoa4P06728 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apoa4P06728 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apoa4P06728 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apoa4P06728 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apoa4P06728 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apoa4P06728 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apoa4P06728 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apoa4P06728 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Apoa4P06728 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apoa4P06728 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apoa4P06728 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apoa4P06728 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apoa4P06728 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apoa4P06728 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apoa4P06728 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apoa4P06728 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apoa4P06728 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apoa4P06728 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apoa4P06728 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apoa4P06728 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Apoa4P06728 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Apoa4P06728 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Apoa4P06728 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apoa4P06728 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apoa4P06728 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Apoa4P06728 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Apoa4P06728 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Apoa4P06728 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Apoa4P06728 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Apoa4P06728 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Apoa4P06728 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apoa4P06728 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apoa4P06728 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apoa4P06728 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apoa4P06728 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apoa4P06728 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apoa4P06728 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apoa4P06728 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apoa4P06728 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apoa4P06728 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apoa4P06728 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apoa4P06728 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apoa4P06728 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apoa4P06728 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Apoa4P06728 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apoa4P06728 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apoa4P06728 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apoa4P06728 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Apoa4P06728 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Apoa4P06728 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apoa4P06728 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apoa4P06728 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apoa4P06728 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apoa4P06728 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apoa4P06728 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apoa4P06728 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apoa4P06728 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Apoa4P06728 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Apoa4P06728 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apoa4P06728 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apoa4P06728 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apoa4P06728 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apoa4P06728 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apoa4P06728 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apoa4P06728 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apoa4P06728 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apoa4P06728 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apoa4P06728 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apoa4P06728 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apoa4P06728 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apoa4P06728 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apoa4P06728 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apoa4P06728 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Apoa4P06728 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apoa4P06728 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apoa4P06728 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apoa4P06728 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apoa4P06728 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apoa4P06728 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apoa4P06728 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apoa4P06728 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apoa4P06728 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apoa4P06728 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apoa4P06728 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apoa4P06728 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apoa4P06728 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apoa4P06728 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Apoa4P06728 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Apoa4P06728 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Apoa4P06728 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Apoa4P06728 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Apoa4P06728 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Apoa4P06728 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Apoa4P06728 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Apoa4P06728 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms