Protein–RNA interactions for Protein: P02716

Chrnd, Acetylcholine receptor subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChrndP02716 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ChrndP02716 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ChrndP02716 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ChrndP02716 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ChrndP02716 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ChrndP02716 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ChrndP02716 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ChrndP02716 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ChrndP02716 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ChrndP02716 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChrndP02716 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ChrndP02716 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChrndP02716 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChrndP02716 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ChrndP02716 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ChrndP02716 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ChrndP02716 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ChrndP02716 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ChrndP02716 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ChrndP02716 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ChrndP02716 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ChrndP02716 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ChrndP02716 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ChrndP02716 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ChrndP02716 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ChrndP02716 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ChrndP02716 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ChrndP02716 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ChrndP02716 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ChrndP02716 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ChrndP02716 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ChrndP02716 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ChrndP02716 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ChrndP02716 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ChrndP02716 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ChrndP02716 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ChrndP02716 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ChrndP02716 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ChrndP02716 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ChrndP02716 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ChrndP02716 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ChrndP02716 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ChrndP02716 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ChrndP02716 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ChrndP02716 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ChrndP02716 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ChrndP02716 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ChrndP02716 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ChrndP02716 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ChrndP02716 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ChrndP02716 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ChrndP02716 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ChrndP02716 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ChrndP02716 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ChrndP02716 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ChrndP02716 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ChrndP02716 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ChrndP02716 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ChrndP02716 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ChrndP02716 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChrndP02716 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ChrndP02716 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ChrndP02716 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ChrndP02716 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ChrndP02716 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ChrndP02716 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChrndP02716 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChrndP02716 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChrndP02716 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ChrndP02716 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ChrndP02716 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChrndP02716 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChrndP02716 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChrndP02716 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChrndP02716 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChrndP02716 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChrndP02716 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChrndP02716 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ChrndP02716 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ChrndP02716 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChrndP02716 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChrndP02716 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChrndP02716 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChrndP02716 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChrndP02716 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChrndP02716 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChrndP02716 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ChrndP02716 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChrndP02716 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChrndP02716 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChrndP02716 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChrndP02716 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChrndP02716 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChrndP02716 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ChrndP02716 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ChrndP02716 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ChrndP02716 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ChrndP02716 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChrndP02716 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChrndP02716 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms