Protein–RNA interactions for Protein: O88986

Gcat, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcatO88986 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GcatO88986 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GcatO88986 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GcatO88986 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GcatO88986 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GcatO88986 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GcatO88986 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GcatO88986 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GcatO88986 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GcatO88986 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GcatO88986 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GcatO88986 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GcatO88986 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GcatO88986 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GcatO88986 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GcatO88986 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GcatO88986 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GcatO88986 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GcatO88986 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GcatO88986 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GcatO88986 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GcatO88986 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GcatO88986 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GcatO88986 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GcatO88986 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GcatO88986 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GcatO88986 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GcatO88986 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GcatO88986 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GcatO88986 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GcatO88986 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GcatO88986 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GcatO88986 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GcatO88986 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GcatO88986 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GcatO88986 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GcatO88986 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GcatO88986 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GcatO88986 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GcatO88986 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GcatO88986 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GcatO88986 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GcatO88986 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GcatO88986 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GcatO88986 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GcatO88986 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GcatO88986 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GcatO88986 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GcatO88986 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GcatO88986 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GcatO88986 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GcatO88986 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GcatO88986 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GcatO88986 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GcatO88986 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GcatO88986 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GcatO88986 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GcatO88986 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GcatO88986 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GcatO88986 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GcatO88986 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GcatO88986 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GcatO88986 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GcatO88986 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GcatO88986 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GcatO88986 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GcatO88986 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GcatO88986 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GcatO88986 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GcatO88986 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GcatO88986 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GcatO88986 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GcatO88986 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GcatO88986 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GcatO88986 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GcatO88986 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GcatO88986 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GcatO88986 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GcatO88986 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GcatO88986 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GcatO88986 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GcatO88986 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GcatO88986 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GcatO88986 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GcatO88986 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GcatO88986 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GcatO88986 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GcatO88986 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GcatO88986 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GcatO88986 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GcatO88986 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GcatO88986 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GcatO88986 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GcatO88986 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GcatO88986 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GcatO88986 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GcatO88986 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GcatO88986 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GcatO88986 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GcatO88986 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms