Protein–RNA interactions for Protein: O88978

Lrrc6, Protein tilB homolog, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc6O88978 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrrc6O88978 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrrc6O88978 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrrc6O88978 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Lrrc6O88978 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrrc6O88978 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrrc6O88978 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrrc6O88978 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrrc6O88978 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lrrc6O88978 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lrrc6O88978 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lrrc6O88978 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lrrc6O88978 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrrc6O88978 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrrc6O88978 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrrc6O88978 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lrrc6O88978 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lrrc6O88978 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lrrc6O88978 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Lrrc6O88978 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lrrc6O88978 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Lrrc6O88978 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lrrc6O88978 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrrc6O88978 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrrc6O88978 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrrc6O88978 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrrc6O88978 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lrrc6O88978 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lrrc6O88978 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Lrrc6O88978 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrc6O88978 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrc6O88978 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrc6O88978 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrc6O88978 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrc6O88978 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrc6O88978 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrrc6O88978 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrrc6O88978 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrrc6O88978 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrrc6O88978 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrrc6O88978 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrrc6O88978 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrrc6O88978 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrrc6O88978 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrrc6O88978 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrrc6O88978 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrrc6O88978 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lrrc6O88978 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrrc6O88978 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrrc6O88978 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrrc6O88978 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrrc6O88978 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrrc6O88978 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrrc6O88978 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lrrc6O88978 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrc6O88978 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrc6O88978 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrc6O88978 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrc6O88978 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrc6O88978 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrrc6O88978 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lrrc6O88978 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lrrc6O88978 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lrrc6O88978 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrrc6O88978 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrrc6O88978 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrrc6O88978 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrrc6O88978 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lrrc6O88978 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrrc6O88978 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lrrc6O88978 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrrc6O88978 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrrc6O88978 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrrc6O88978 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrrc6O88978 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrrc6O88978 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrc6O88978 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrc6O88978 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrc6O88978 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrc6O88978 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrc6O88978 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrrc6O88978 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrrc6O88978 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrrc6O88978 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrrc6O88978 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrrc6O88978 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrc6O88978 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrc6O88978 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrc6O88978 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrc6O88978 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrc6O88978 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrc6O88978 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrc6O88978 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrc6O88978 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrc6O88978 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrc6O88978 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrc6O88978 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lrrc6O88978 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrrc6O88978 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrrc6O88978 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms