Protein–RNA interactions for Protein: O70172

Pip4k2a, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4k2aO70172 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pip4k2aO70172 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pip4k2aO70172 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pip4k2aO70172 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pip4k2aO70172 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pip4k2aO70172 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pip4k2aO70172 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pip4k2aO70172 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pip4k2aO70172 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pip4k2aO70172 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Pip4k2aO70172 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pip4k2aO70172 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pip4k2aO70172 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pip4k2aO70172 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pip4k2aO70172 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pip4k2aO70172 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pip4k2aO70172 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pip4k2aO70172 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pip4k2aO70172 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pip4k2aO70172 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pip4k2aO70172 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pip4k2aO70172 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pip4k2aO70172 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pip4k2aO70172 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pip4k2aO70172 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pip4k2aO70172 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pip4k2aO70172 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pip4k2aO70172 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pip4k2aO70172 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pip4k2aO70172 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Pip4k2aO70172 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pip4k2aO70172 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pip4k2aO70172 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pip4k2aO70172 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pip4k2aO70172 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pip4k2aO70172 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Pip4k2aO70172 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Pip4k2aO70172 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pip4k2aO70172 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pip4k2aO70172 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pip4k2aO70172 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pip4k2aO70172 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pip4k2aO70172 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Pip4k2aO70172 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pip4k2aO70172 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pip4k2aO70172 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Pip4k2aO70172 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pip4k2aO70172 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pip4k2aO70172 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pip4k2aO70172 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pip4k2aO70172 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pip4k2aO70172 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pip4k2aO70172 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pip4k2aO70172 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pip4k2aO70172 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pip4k2aO70172 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pip4k2aO70172 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pip4k2aO70172 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pip4k2aO70172 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pip4k2aO70172 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pip4k2aO70172 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pip4k2aO70172 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Pip4k2aO70172 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Pip4k2aO70172 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pip4k2aO70172 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pip4k2aO70172 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pip4k2aO70172 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pip4k2aO70172 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pip4k2aO70172 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pip4k2aO70172 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pip4k2aO70172 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pip4k2aO70172 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pip4k2aO70172 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pip4k2aO70172 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pip4k2aO70172 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pip4k2aO70172 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pip4k2aO70172 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pip4k2aO70172 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pip4k2aO70172 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pip4k2aO70172 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pip4k2aO70172 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pip4k2aO70172 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pip4k2aO70172 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pip4k2aO70172 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Pip4k2aO70172 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pip4k2aO70172 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pip4k2aO70172 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pip4k2aO70172 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pip4k2aO70172 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pip4k2aO70172 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pip4k2aO70172 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pip4k2aO70172 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pip4k2aO70172 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pip4k2aO70172 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pip4k2aO70172 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pip4k2aO70172 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pip4k2aO70172 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pip4k2aO70172 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pip4k2aO70172 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pip4k2aO70172 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.7 ms