Protein–RNA interactions for Protein: O55003

Bnip3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip3O55003 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Bnip3O55003 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Bnip3O55003 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Bnip3O55003 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,63■■■□□ 2,33
Bnip3O55003 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Bnip3O55003 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29,61■■■□□ 2,33
Bnip3O55003 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Bnip3O55003 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29,6■■■□□ 2,33
Bnip3O55003 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29,6■■■□□ 2,33
Bnip3O55003 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Bnip3O55003 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Bnip3O55003 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Bnip3O55003 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Bnip3O55003 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,58■■■□□ 2,33
Bnip3O55003 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Bnip3O55003 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29,56■■■□□ 2,32
Bnip3O55003 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Bnip3O55003 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Bnip3O55003 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29,55■■■□□ 2,32
Bnip3O55003 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Bnip3O55003 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Bnip3O55003 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29,52■■■□□ 2,32
Bnip3O55003 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Bnip3O55003 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Bnip3O55003 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Bnip3O55003 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Bnip3O55003 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Bnip3O55003 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Bnip3O55003 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Bnip3O55003 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Bnip3O55003 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Bnip3O55003 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,3
Bnip3O55003 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Bnip3O55003 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Bnip3O55003 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Bnip3O55003 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29,42■■■□□ 2,3
Bnip3O55003 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Bnip3O55003 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Bnip3O55003 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Bnip3O55003 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Bnip3O55003 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Bnip3O55003 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29,38■■■□□ 2,29
Bnip3O55003 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Bnip3O55003 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Bnip3O55003 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Bnip3O55003 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Bnip3O55003 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29,35■■■□□ 2,29
Bnip3O55003 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29,34■■■□□ 2,29
Bnip3O55003 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Bnip3O55003 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Bnip3O55003 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Bnip3O55003 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Bnip3O55003 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Bnip3O55003 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Bnip3O55003 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Bnip3O55003 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Bnip3O55003 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Bnip3O55003 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Bnip3O55003 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Bnip3O55003 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29,27■■■□□ 2,28
Bnip3O55003 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Bnip3O55003 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29,26■■■□□ 2,27
Bnip3O55003 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29,25■■■□□ 2,27
Bnip3O55003 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Bnip3O55003 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29,23■■■□□ 2,27
Bnip3O55003 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Bnip3O55003 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,22■■■□□ 2,27
Bnip3O55003 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29,22■■■□□ 2,27
Bnip3O55003 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Bnip3O55003 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29,2■■■□□ 2,26
Bnip3O55003 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Bnip3O55003 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,19■■■□□ 2,26
Bnip3O55003 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Bnip3O55003 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Bnip3O55003 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Bnip3O55003 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Bnip3O55003 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Bnip3O55003 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29,13■■■□□ 2,25
Bnip3O55003 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,12■■■□□ 2,25
Bnip3O55003 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Bnip3O55003 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Bnip3O55003 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Bnip3O55003 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Bnip3O55003 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Bnip3O55003 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Bnip3O55003 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Bnip3O55003 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Bnip3O55003 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29,07■■■□□ 2,24
Bnip3O55003 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Bnip3O55003 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Bnip3O55003 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Bnip3O55003 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Bnip3O55003 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Bnip3O55003 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Bnip3O55003 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Bnip3O55003 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Bnip3O55003 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Bnip3O55003 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29,03■■■□□ 2,24
Bnip3O55003 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Bnip3O55003 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29,01■■■□□ 2,23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,5 ms