Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ChkaO54804 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ChkaO54804 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ChkaO54804 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ChkaO54804 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ChkaO54804 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ChkaO54804 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ChkaO54804 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ChkaO54804 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ChkaO54804 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ChkaO54804 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ChkaO54804 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ChkaO54804 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ChkaO54804 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ChkaO54804 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ChkaO54804 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ChkaO54804 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ChkaO54804 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ChkaO54804 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ChkaO54804 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ChkaO54804 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ChkaO54804 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ChkaO54804 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ChkaO54804 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ChkaO54804 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ChkaO54804 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ChkaO54804 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ChkaO54804 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ChkaO54804 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ChkaO54804 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ChkaO54804 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ChkaO54804 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ChkaO54804 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ChkaO54804 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ChkaO54804 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ChkaO54804 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ChkaO54804 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ChkaO54804 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ChkaO54804 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ChkaO54804 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ChkaO54804 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ChkaO54804 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ChkaO54804 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ChkaO54804 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ChkaO54804 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ChkaO54804 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ChkaO54804 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ChkaO54804 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ChkaO54804 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ChkaO54804 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ChkaO54804 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ChkaO54804 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ChkaO54804 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ChkaO54804 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ChkaO54804 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ChkaO54804 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ChkaO54804 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ChkaO54804 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ChkaO54804 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ChkaO54804 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ChkaO54804 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ChkaO54804 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ChkaO54804 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ChkaO54804 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ChkaO54804 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ChkaO54804 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ChkaO54804 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ChkaO54804 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ChkaO54804 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ChkaO54804 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ChkaO54804 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ChkaO54804 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ChkaO54804 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ChkaO54804 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ChkaO54804 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ChkaO54804 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ChkaO54804 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ChkaO54804 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ChkaO54804 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ChkaO54804 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ChkaO54804 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ChkaO54804 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ChkaO54804 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ChkaO54804 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ChkaO54804 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ChkaO54804 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ChkaO54804 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ChkaO54804 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ChkaO54804 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ChkaO54804 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ChkaO54804 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ChkaO54804 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ChkaO54804 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ChkaO54804 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ChkaO54804 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ChkaO54804 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ChkaO54804 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ChkaO54804 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ChkaO54804 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ChkaO54804 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms