Protein–RNA interactions for Protein: O35732

Cflar, CASP8 and FADD-like apoptosis regulator, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CflarO35732 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CflarO35732 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CflarO35732 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CflarO35732 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CflarO35732 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CflarO35732 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CflarO35732 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CflarO35732 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CflarO35732 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CflarO35732 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CflarO35732 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CflarO35732 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CflarO35732 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CflarO35732 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CflarO35732 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CflarO35732 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CflarO35732 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CflarO35732 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CflarO35732 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CflarO35732 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CflarO35732 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CflarO35732 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CflarO35732 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CflarO35732 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CflarO35732 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CflarO35732 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CflarO35732 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CflarO35732 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CflarO35732 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CflarO35732 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CflarO35732 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CflarO35732 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CflarO35732 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CflarO35732 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CflarO35732 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CflarO35732 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CflarO35732 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CflarO35732 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CflarO35732 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CflarO35732 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CflarO35732 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CflarO35732 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CflarO35732 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CflarO35732 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CflarO35732 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CflarO35732 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CflarO35732 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CflarO35732 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CflarO35732 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CflarO35732 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CflarO35732 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CflarO35732 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CflarO35732 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CflarO35732 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CflarO35732 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CflarO35732 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CflarO35732 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CflarO35732 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CflarO35732 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CflarO35732 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CflarO35732 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CflarO35732 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CflarO35732 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CflarO35732 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CflarO35732 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CflarO35732 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CflarO35732 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CflarO35732 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CflarO35732 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CflarO35732 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CflarO35732 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CflarO35732 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CflarO35732 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CflarO35732 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CflarO35732 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CflarO35732 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CflarO35732 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CflarO35732 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CflarO35732 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CflarO35732 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CflarO35732 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CflarO35732 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CflarO35732 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CflarO35732 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CflarO35732 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CflarO35732 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CflarO35732 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CflarO35732 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CflarO35732 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CflarO35732 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CflarO35732 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CflarO35732 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CflarO35732 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CflarO35732 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CflarO35732 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CflarO35732 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CflarO35732 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CflarO35732 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CflarO35732 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CflarO35732 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms