Protein–RNA interactions for Protein: O35657

Neu1, Sialidase-1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neu1O35657 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Neu1O35657 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Neu1O35657 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Neu1O35657 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Neu1O35657 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Neu1O35657 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Neu1O35657 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Neu1O35657 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Neu1O35657 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Neu1O35657 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Neu1O35657 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Neu1O35657 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Neu1O35657 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Neu1O35657 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Neu1O35657 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Neu1O35657 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Neu1O35657 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Neu1O35657 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Neu1O35657 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Neu1O35657 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Neu1O35657 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Neu1O35657 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Neu1O35657 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Neu1O35657 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Neu1O35657 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Neu1O35657 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Neu1O35657 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Neu1O35657 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Neu1O35657 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Neu1O35657 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Neu1O35657 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Neu1O35657 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Neu1O35657 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Neu1O35657 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Neu1O35657 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Neu1O35657 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Neu1O35657 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Neu1O35657 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Neu1O35657 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Neu1O35657 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Neu1O35657 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Neu1O35657 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Neu1O35657 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Neu1O35657 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Neu1O35657 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Neu1O35657 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Neu1O35657 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Neu1O35657 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Neu1O35657 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Neu1O35657 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Neu1O35657 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Neu1O35657 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Neu1O35657 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Neu1O35657 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Neu1O35657 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Neu1O35657 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Neu1O35657 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Neu1O35657 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Neu1O35657 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Neu1O35657 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Neu1O35657 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Neu1O35657 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Neu1O35657 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Neu1O35657 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Neu1O35657 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Neu1O35657 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Neu1O35657 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Neu1O35657 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Neu1O35657 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Neu1O35657 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Neu1O35657 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Neu1O35657 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Neu1O35657 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Neu1O35657 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Neu1O35657 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Neu1O35657 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Neu1O35657 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Neu1O35657 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Neu1O35657 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Neu1O35657 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Neu1O35657 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Neu1O35657 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Neu1O35657 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Neu1O35657 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Neu1O35657 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Neu1O35657 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Neu1O35657 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Neu1O35657 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Neu1O35657 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Neu1O35657 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Neu1O35657 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Neu1O35657 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Neu1O35657 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Neu1O35657 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Neu1O35657 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Neu1O35657 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Neu1O35657 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Neu1O35657 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Neu1O35657 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Neu1O35657 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.6 ms