Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Snap23O09044 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Snap23O09044 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Snap23O09044 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Snap23O09044 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Snap23O09044 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Snap23O09044 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Snap23O09044 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Snap23O09044 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Snap23O09044 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Snap23O09044 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Snap23O09044 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Snap23O09044 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Snap23O09044 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Snap23O09044 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Snap23O09044 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Snap23O09044 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Snap23O09044 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Snap23O09044 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Snap23O09044 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Snap23O09044 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Snap23O09044 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Snap23O09044 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Snap23O09044 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Snap23O09044 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Snap23O09044 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Snap23O09044 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Snap23O09044 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Snap23O09044 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Snap23O09044 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Snap23O09044 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Snap23O09044 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Snap23O09044 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Snap23O09044 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Snap23O09044 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Snap23O09044 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Snap23O09044 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Snap23O09044 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Snap23O09044 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Snap23O09044 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Snap23O09044 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Snap23O09044 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Snap23O09044 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Snap23O09044 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Snap23O09044 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Snap23O09044 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Snap23O09044 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Snap23O09044 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Snap23O09044 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Snap23O09044 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Snap23O09044 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Snap23O09044 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Snap23O09044 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Snap23O09044 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Snap23O09044 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Snap23O09044 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Snap23O09044 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Snap23O09044 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Snap23O09044 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Snap23O09044 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Snap23O09044 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Snap23O09044 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Snap23O09044 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Snap23O09044 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Snap23O09044 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Snap23O09044 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Snap23O09044 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Snap23O09044 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Snap23O09044 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Snap23O09044 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Snap23O09044 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Snap23O09044 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Snap23O09044 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Snap23O09044 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Snap23O09044 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Snap23O09044 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Snap23O09044 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Snap23O09044 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Snap23O09044 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Snap23O09044 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Snap23O09044 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Snap23O09044 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Snap23O09044 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Snap23O09044 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Snap23O09044 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Snap23O09044 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Snap23O09044 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Snap23O09044 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Snap23O09044 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Snap23O09044 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Snap23O09044 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Snap23O09044 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Snap23O09044 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Snap23O09044 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Snap23O09044 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Snap23O09044 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Snap23O09044 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Snap23O09044 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Snap23O09044 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Snap23O09044 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 378.2 ms