Protein–RNA interactions for Protein: O08848

Trove2, 60 kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trove2O08848 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trove2O08848 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trove2O08848 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trove2O08848 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trove2O08848 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trove2O08848 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trove2O08848 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trove2O08848 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trove2O08848 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trove2O08848 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trove2O08848 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trove2O08848 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trove2O08848 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trove2O08848 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trove2O08848 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trove2O08848 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trove2O08848 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Trove2O08848 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Trove2O08848 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trove2O08848 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Trove2O08848 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trove2O08848 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trove2O08848 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trove2O08848 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trove2O08848 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trove2O08848 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trove2O08848 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trove2O08848 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trove2O08848 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trove2O08848 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trove2O08848 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trove2O08848 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trove2O08848 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trove2O08848 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trove2O08848 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trove2O08848 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trove2O08848 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trove2O08848 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trove2O08848 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trove2O08848 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trove2O08848 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trove2O08848 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trove2O08848 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trove2O08848 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trove2O08848 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trove2O08848 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trove2O08848 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trove2O08848 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trove2O08848 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trove2O08848 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trove2O08848 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trove2O08848 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trove2O08848 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trove2O08848 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trove2O08848 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trove2O08848 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trove2O08848 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trove2O08848 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trove2O08848 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trove2O08848 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trove2O08848 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trove2O08848 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trove2O08848 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trove2O08848 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trove2O08848 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trove2O08848 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trove2O08848 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trove2O08848 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trove2O08848 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trove2O08848 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trove2O08848 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trove2O08848 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trove2O08848 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trove2O08848 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trove2O08848 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trove2O08848 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trove2O08848 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trove2O08848 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trove2O08848 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trove2O08848 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trove2O08848 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trove2O08848 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trove2O08848 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trove2O08848 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trove2O08848 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trove2O08848 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trove2O08848 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trove2O08848 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trove2O08848 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trove2O08848 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trove2O08848 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trove2O08848 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trove2O08848 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trove2O08848 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trove2O08848 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Trove2O08848 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trove2O08848 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trove2O08848 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trove2O08848 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Trove2O08848 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms