Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3239L7N2D9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3239L7N2D9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3239L7N2D9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3239L7N2D9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3239L7N2D9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3239L7N2D9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3239L7N2D9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3239L7N2D9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3239L7N2D9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3239L7N2D9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3239L7N2D9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm3239L7N2D9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3239L7N2D9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3239L7N2D9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3239L7N2D9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3239L7N2D9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3239L7N2D9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3239L7N2D9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3239L7N2D9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm3239L7N2D9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm3239L7N2D9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3239L7N2D9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3239L7N2D9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3239L7N2D9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3239L7N2D9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3239L7N2D9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3239L7N2D9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3239L7N2D9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3239L7N2D9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3239L7N2D9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3239L7N2D9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3239L7N2D9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3239L7N2D9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3239L7N2D9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3239L7N2D9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3239L7N2D9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3239L7N2D9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3239L7N2D9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3239L7N2D9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3239L7N2D9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3239L7N2D9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3239L7N2D9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3239L7N2D9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3239L7N2D9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3239L7N2D9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3239L7N2D9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3239L7N2D9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3239L7N2D9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3239L7N2D9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3239L7N2D9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3239L7N2D9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3239L7N2D9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3239L7N2D9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3239L7N2D9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3239L7N2D9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3239L7N2D9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3239L7N2D9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3239L7N2D9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm3239L7N2D9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm3239L7N2D9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm3239L7N2D9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm3239L7N2D9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3239L7N2D9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3239L7N2D9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3239L7N2D9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3239L7N2D9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3239L7N2D9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3239L7N2D9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3239L7N2D9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3239L7N2D9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3239L7N2D9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3239L7N2D9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3239L7N2D9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3239L7N2D9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3239L7N2D9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3239L7N2D9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3239L7N2D9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3239L7N2D9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3239L7N2D9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3239L7N2D9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3239L7N2D9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm3239L7N2D9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3239L7N2D9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3239L7N2D9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3239L7N2D9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3239L7N2D9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3239L7N2D9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3239L7N2D9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3239L7N2D9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3239L7N2D9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3239L7N2D9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3239L7N2D9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3239L7N2D9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3239L7N2D9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3239L7N2D9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3239L7N2D9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3239L7N2D9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3239L7N2D9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3239L7N2D9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms