Protein–RNA interactions for Protein: K7N688

Vmn1r27, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r27K7N688 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r27K7N688 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r27K7N688 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r27K7N688 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn1r27K7N688 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn1r27K7N688 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn1r27K7N688 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn1r27K7N688 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn1r27K7N688 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r27K7N688 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r27K7N688 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn1r27K7N688 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn1r27K7N688 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn1r27K7N688 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r27K7N688 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r27K7N688 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r27K7N688 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r27K7N688 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r27K7N688 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vmn1r27K7N688 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn1r27K7N688 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn1r27K7N688 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn1r27K7N688 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn1r27K7N688 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r27K7N688 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r27K7N688 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r27K7N688 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r27K7N688 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r27K7N688 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn1r27K7N688 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn1r27K7N688 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r27K7N688 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vmn1r27K7N688 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r27K7N688 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r27K7N688 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r27K7N688 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r27K7N688 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r27K7N688 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r27K7N688 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r27K7N688 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r27K7N688 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r27K7N688 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r27K7N688 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r27K7N688 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r27K7N688 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r27K7N688 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r27K7N688 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r27K7N688 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r27K7N688 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r27K7N688 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r27K7N688 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r27K7N688 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r27K7N688 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r27K7N688 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r27K7N688 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r27K7N688 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r27K7N688 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r27K7N688 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r27K7N688 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r27K7N688 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r27K7N688 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r27K7N688 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r27K7N688 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r27K7N688 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r27K7N688 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r27K7N688 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r27K7N688 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r27K7N688 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r27K7N688 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r27K7N688 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r27K7N688 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r27K7N688 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r27K7N688 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vmn1r27K7N688 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r27K7N688 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r27K7N688 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r27K7N688 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r27K7N688 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r27K7N688 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r27K7N688 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r27K7N688 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r27K7N688 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r27K7N688 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r27K7N688 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r27K7N688 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r27K7N688 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r27K7N688 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r27K7N688 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r27K7N688 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vmn1r27K7N688 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vmn1r27K7N688 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r27K7N688 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r27K7N688 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r27K7N688 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r27K7N688 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r27K7N688 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r27K7N688 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r27K7N688 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r27K7N688 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r27K7N688 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms