Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm2056J3QQ02 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm2056J3QQ02 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm2056J3QQ02 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm2056J3QQ02 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm2056J3QQ02 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm2056J3QQ02 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm2056J3QQ02 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm2056J3QQ02 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm2056J3QQ02 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm2056J3QQ02 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm2056J3QQ02 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm2056J3QQ02 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm2056J3QQ02 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm2056J3QQ02 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm2056J3QQ02 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm2056J3QQ02 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm2056J3QQ02 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm2056J3QQ02 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm2056J3QQ02 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm2056J3QQ02 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm2056J3QQ02 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm2056J3QQ02 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm2056J3QQ02 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm2056J3QQ02 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm2056J3QQ02 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm2056J3QQ02 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm2056J3QQ02 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm2056J3QQ02 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm2056J3QQ02 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm2056J3QQ02 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm2056J3QQ02 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm2056J3QQ02 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm2056J3QQ02 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm2056J3QQ02 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm2056J3QQ02 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm2056J3QQ02 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm2056J3QQ02 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm2056J3QQ02 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm2056J3QQ02 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm2056J3QQ02 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm2056J3QQ02 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm2056J3QQ02 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm2056J3QQ02 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm2056J3QQ02 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm2056J3QQ02 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm2056J3QQ02 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm2056J3QQ02 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm2056J3QQ02 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm2056J3QQ02 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm2056J3QQ02 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm2056J3QQ02 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm2056J3QQ02 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm2056J3QQ02 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm2056J3QQ02 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm2056J3QQ02 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm2056J3QQ02 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm2056J3QQ02 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm2056J3QQ02 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm2056J3QQ02 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm2056J3QQ02 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm2056J3QQ02 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm2056J3QQ02 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm2056J3QQ02 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm2056J3QQ02 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm2056J3QQ02 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm2056J3QQ02 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm2056J3QQ02 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm2056J3QQ02 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm2056J3QQ02 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm2056J3QQ02 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm2056J3QQ02 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm2056J3QQ02 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm2056J3QQ02 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm2056J3QQ02 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm2056J3QQ02 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm2056J3QQ02 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm2056J3QQ02 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm2056J3QQ02 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm2056J3QQ02 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm2056J3QQ02 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm2056J3QQ02 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm2056J3QQ02 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm2056J3QQ02 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm2056J3QQ02 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm2056J3QQ02 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm2056J3QQ02 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm2056J3QQ02 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm2056J3QQ02 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm2056J3QQ02 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm2056J3QQ02 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm2056J3QQ02 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm2056J3QQ02 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm2056J3QQ02 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm2056J3QQ02 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm2056J3QQ02 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm2056J3QQ02 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm2056J3QQ02 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm2056J3QQ02 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm2056J3QQ02 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms