Protein–RNA interactions for Protein: G5E8L3

Nat8f4, MCG128680, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nat8f4G5E8L3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nat8f4G5E8L3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nat8f4G5E8L3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nat8f4G5E8L3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nat8f4G5E8L3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nat8f4G5E8L3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nat8f4G5E8L3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nat8f4G5E8L3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nat8f4G5E8L3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nat8f4G5E8L3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nat8f4G5E8L3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nat8f4G5E8L3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nat8f4G5E8L3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nat8f4G5E8L3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nat8f4G5E8L3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nat8f4G5E8L3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nat8f4G5E8L3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nat8f4G5E8L3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nat8f4G5E8L3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nat8f4G5E8L3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nat8f4G5E8L3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nat8f4G5E8L3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nat8f4G5E8L3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nat8f4G5E8L3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nat8f4G5E8L3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nat8f4G5E8L3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nat8f4G5E8L3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nat8f4G5E8L3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nat8f4G5E8L3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nat8f4G5E8L3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nat8f4G5E8L3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nat8f4G5E8L3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nat8f4G5E8L3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nat8f4G5E8L3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nat8f4G5E8L3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nat8f4G5E8L3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nat8f4G5E8L3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nat8f4G5E8L3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nat8f4G5E8L3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nat8f4G5E8L3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nat8f4G5E8L3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nat8f4G5E8L3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nat8f4G5E8L3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nat8f4G5E8L3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nat8f4G5E8L3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nat8f4G5E8L3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nat8f4G5E8L3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nat8f4G5E8L3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nat8f4G5E8L3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nat8f4G5E8L3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nat8f4G5E8L3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nat8f4G5E8L3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nat8f4G5E8L3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nat8f4G5E8L3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nat8f4G5E8L3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nat8f4G5E8L3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nat8f4G5E8L3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nat8f4G5E8L3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nat8f4G5E8L3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nat8f4G5E8L3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nat8f4G5E8L3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nat8f4G5E8L3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nat8f4G5E8L3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nat8f4G5E8L3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nat8f4G5E8L3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nat8f4G5E8L3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nat8f4G5E8L3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nat8f4G5E8L3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nat8f4G5E8L3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nat8f4G5E8L3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nat8f4G5E8L3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nat8f4G5E8L3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nat8f4G5E8L3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nat8f4G5E8L3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nat8f4G5E8L3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nat8f4G5E8L3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nat8f4G5E8L3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nat8f4G5E8L3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nat8f4G5E8L3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nat8f4G5E8L3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nat8f4G5E8L3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nat8f4G5E8L3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nat8f4G5E8L3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nat8f4G5E8L3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nat8f4G5E8L3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nat8f4G5E8L3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nat8f4G5E8L3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nat8f4G5E8L3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nat8f4G5E8L3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nat8f4G5E8L3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nat8f4G5E8L3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nat8f4G5E8L3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nat8f4G5E8L3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nat8f4G5E8L3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nat8f4G5E8L3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nat8f4G5E8L3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nat8f4G5E8L3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nat8f4G5E8L3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nat8f4G5E8L3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nat8f4G5E8L3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms