Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn1r58G3X9U3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn1r58G3X9U3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn1r58G3X9U3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r58G3X9U3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r58G3X9U3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r58G3X9U3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r58G3X9U3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r58G3X9U3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r58G3X9U3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r58G3X9U3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r58G3X9U3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r58G3X9U3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r58G3X9U3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r58G3X9U3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r58G3X9U3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r58G3X9U3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r58G3X9U3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r58G3X9U3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vmn1r58G3X9U3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r58G3X9U3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r58G3X9U3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r58G3X9U3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r58G3X9U3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r58G3X9U3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r58G3X9U3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r58G3X9U3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r58G3X9U3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r58G3X9U3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r58G3X9U3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r58G3X9U3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r58G3X9U3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn1r58G3X9U3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn1r58G3X9U3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vmn1r58G3X9U3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn1r58G3X9U3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn1r58G3X9U3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn1r58G3X9U3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r58G3X9U3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r58G3X9U3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r58G3X9U3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r58G3X9U3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r58G3X9U3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r58G3X9U3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Vmn1r58G3X9U3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r58G3X9U3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r58G3X9U3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r58G3X9U3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r58G3X9U3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r58G3X9U3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r58G3X9U3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r58G3X9U3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r58G3X9U3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r58G3X9U3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r58G3X9U3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r58G3X9U3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r58G3X9U3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r58G3X9U3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r58G3X9U3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r58G3X9U3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r58G3X9U3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r58G3X9U3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r58G3X9U3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r58G3X9U3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r58G3X9U3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r58G3X9U3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r58G3X9U3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r58G3X9U3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r58G3X9U3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r58G3X9U3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r58G3X9U3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r58G3X9U3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r58G3X9U3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r58G3X9U3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r58G3X9U3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r58G3X9U3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r58G3X9U3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r58G3X9U3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r58G3X9U3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r58G3X9U3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r58G3X9U3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r58G3X9U3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r58G3X9U3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r58G3X9U3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r58G3X9U3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r58G3X9U3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r58G3X9U3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r58G3X9U3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r58G3X9U3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Vmn1r58G3X9U3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r58G3X9U3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r58G3X9U3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r58G3X9U3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r58G3X9U3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r58G3X9U3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r58G3X9U3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r58G3X9U3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r58G3X9U3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r58G3X9U3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms