Protein–RNA interactions for Protein: G3X9N3

Pnmal2, MCG16539, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnmal2G3X9N3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Pnmal2G3X9N3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Pnmal2G3X9N3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Pnmal2G3X9N3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Pnmal2G3X9N3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Pnmal2G3X9N3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Pnmal2G3X9N3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Pnmal2G3X9N3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Pnmal2G3X9N3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Pnmal2G3X9N3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Pnmal2G3X9N3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Pnmal2G3X9N3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Pnmal2G3X9N3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Pnmal2G3X9N3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Pnmal2G3X9N3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Pnmal2G3X9N3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Pnmal2G3X9N3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Pnmal2G3X9N3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Pnmal2G3X9N3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Pnmal2G3X9N3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Pnmal2G3X9N3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Pnmal2G3X9N3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Pnmal2G3X9N3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Pnmal2G3X9N3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Pnmal2G3X9N3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Pnmal2G3X9N3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
Pnmal2G3X9N3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
Pnmal2G3X9N3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Pnmal2G3X9N3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Pnmal2G3X9N3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Pnmal2G3X9N3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Pnmal2G3X9N3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Pnmal2G3X9N3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Pnmal2G3X9N3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Pnmal2G3X9N3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Pnmal2G3X9N3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Pnmal2G3X9N3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Pnmal2G3X9N3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Pnmal2G3X9N3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pnmal2G3X9N3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pnmal2G3X9N3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Pnmal2G3X9N3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Pnmal2G3X9N3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Pnmal2G3X9N3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Pnmal2G3X9N3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Pnmal2G3X9N3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Pnmal2G3X9N3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Pnmal2G3X9N3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Pnmal2G3X9N3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Pnmal2G3X9N3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Pnmal2G3X9N3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Pnmal2G3X9N3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Pnmal2G3X9N3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Pnmal2G3X9N3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Pnmal2G3X9N3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Pnmal2G3X9N3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Pnmal2G3X9N3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Pnmal2G3X9N3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Pnmal2G3X9N3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Pnmal2G3X9N3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Pnmal2G3X9N3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Pnmal2G3X9N3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Pnmal2G3X9N3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Pnmal2G3X9N3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Pnmal2G3X9N3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Pnmal2G3X9N3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Pnmal2G3X9N3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Pnmal2G3X9N3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Pnmal2G3X9N3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Pnmal2G3X9N3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Pnmal2G3X9N3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Pnmal2G3X9N3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Pnmal2G3X9N3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Pnmal2G3X9N3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Pnmal2G3X9N3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Pnmal2G3X9N3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Pnmal2G3X9N3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Pnmal2G3X9N3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Pnmal2G3X9N3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Pnmal2G3X9N3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Pnmal2G3X9N3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Pnmal2G3X9N3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Pnmal2G3X9N3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Pnmal2G3X9N3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Pnmal2G3X9N3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Pnmal2G3X9N3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Pnmal2G3X9N3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Pnmal2G3X9N3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Pnmal2G3X9N3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Pnmal2G3X9N3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Pnmal2G3X9N3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Pnmal2G3X9N3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Pnmal2G3X9N3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Pnmal2G3X9N3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Pnmal2G3X9N3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Pnmal2G3X9N3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Pnmal2G3X9N3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Pnmal2G3X9N3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Pnmal2G3X9N3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Pnmal2G3X9N3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms