Protein–RNA interactions for Protein: F8VQH7

Dbx2, Developing brain homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx2F8VQH7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dbx2F8VQH7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dbx2F8VQH7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dbx2F8VQH7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dbx2F8VQH7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dbx2F8VQH7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dbx2F8VQH7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dbx2F8VQH7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dbx2F8VQH7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dbx2F8VQH7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dbx2F8VQH7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dbx2F8VQH7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dbx2F8VQH7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dbx2F8VQH7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dbx2F8VQH7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dbx2F8VQH7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dbx2F8VQH7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dbx2F8VQH7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dbx2F8VQH7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dbx2F8VQH7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dbx2F8VQH7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Dbx2F8VQH7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dbx2F8VQH7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dbx2F8VQH7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dbx2F8VQH7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dbx2F8VQH7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dbx2F8VQH7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dbx2F8VQH7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dbx2F8VQH7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dbx2F8VQH7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dbx2F8VQH7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dbx2F8VQH7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dbx2F8VQH7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dbx2F8VQH7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dbx2F8VQH7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dbx2F8VQH7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dbx2F8VQH7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dbx2F8VQH7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dbx2F8VQH7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Dbx2F8VQH7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dbx2F8VQH7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dbx2F8VQH7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dbx2F8VQH7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dbx2F8VQH7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dbx2F8VQH7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dbx2F8VQH7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dbx2F8VQH7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dbx2F8VQH7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dbx2F8VQH7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dbx2F8VQH7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dbx2F8VQH7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dbx2F8VQH7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dbx2F8VQH7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dbx2F8VQH7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dbx2F8VQH7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dbx2F8VQH7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Dbx2F8VQH7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dbx2F8VQH7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dbx2F8VQH7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dbx2F8VQH7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dbx2F8VQH7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dbx2F8VQH7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dbx2F8VQH7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dbx2F8VQH7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Dbx2F8VQH7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dbx2F8VQH7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dbx2F8VQH7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dbx2F8VQH7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dbx2F8VQH7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dbx2F8VQH7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dbx2F8VQH7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dbx2F8VQH7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dbx2F8VQH7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dbx2F8VQH7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dbx2F8VQH7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dbx2F8VQH7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dbx2F8VQH7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dbx2F8VQH7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dbx2F8VQH7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Dbx2F8VQH7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dbx2F8VQH7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dbx2F8VQH7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dbx2F8VQH7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dbx2F8VQH7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dbx2F8VQH7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dbx2F8VQH7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dbx2F8VQH7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dbx2F8VQH7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dbx2F8VQH7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Dbx2F8VQH7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dbx2F8VQH7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dbx2F8VQH7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dbx2F8VQH7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dbx2F8VQH7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dbx2F8VQH7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dbx2F8VQH7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dbx2F8VQH7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dbx2F8VQH7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dbx2F8VQH7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dbx2F8VQH7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms