Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R7

Utrn, Utrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UtrnE9Q6R7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
UtrnE9Q6R7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
UtrnE9Q6R7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30,27■■■□□ 2,44
UtrnE9Q6R7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC30,26■■■□□ 2,43
UtrnE9Q6R7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
UtrnE9Q6R7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC30,25■■■□□ 2,43
UtrnE9Q6R7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC30,25■■■□□ 2,43
UtrnE9Q6R7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
UtrnE9Q6R7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
UtrnE9Q6R7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
UtrnE9Q6R7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
UtrnE9Q6R7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
UtrnE9Q6R7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
UtrnE9Q6R7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
UtrnE9Q6R7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC30,16■■■□□ 2,42
UtrnE9Q6R7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
UtrnE9Q6R7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
UtrnE9Q6R7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,14■■■□□ 2,42
UtrnE9Q6R7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
UtrnE9Q6R7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
UtrnE9Q6R7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
UtrnE9Q6R7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
UtrnE9Q6R7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
UtrnE9Q6R7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
UtrnE9Q6R7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC30,11■■■□□ 2,41
UtrnE9Q6R7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC30,11■■■□□ 2,41
UtrnE9Q6R7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC30,11■■■□□ 2,41
UtrnE9Q6R7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30,11■■■□□ 2,41
UtrnE9Q6R7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
UtrnE9Q6R7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
UtrnE9Q6R7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
UtrnE9Q6R7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
UtrnE9Q6R7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC30,09■■■□□ 2,41
UtrnE9Q6R7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30,08■■■□□ 2,41
UtrnE9Q6R7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
UtrnE9Q6R7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30,06■■■□□ 2,4
UtrnE9Q6R7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
UtrnE9Q6R7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
UtrnE9Q6R7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30,05■■■□□ 2,4
UtrnE9Q6R7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
UtrnE9Q6R7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC30,05■■■□□ 2,4
UtrnE9Q6R7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
UtrnE9Q6R7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,02■■■□□ 2,4
UtrnE9Q6R7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC30,02■■■□□ 2,4
UtrnE9Q6R7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2,39
UtrnE9Q6R7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
UtrnE9Q6R7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29,99■■■□□ 2,39
UtrnE9Q6R7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
UtrnE9Q6R7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
UtrnE9Q6R7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29,98■■■□□ 2,39
UtrnE9Q6R7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
UtrnE9Q6R7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29,97■■■□□ 2,39
UtrnE9Q6R7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
UtrnE9Q6R7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29,97■■■□□ 2,39
UtrnE9Q6R7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
UtrnE9Q6R7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29,94■■■□□ 2,38
UtrnE9Q6R7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
UtrnE9Q6R7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
UtrnE9Q6R7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,92■■■□□ 2,38
UtrnE9Q6R7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
UtrnE9Q6R7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
UtrnE9Q6R7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
UtrnE9Q6R7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
UtrnE9Q6R7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
UtrnE9Q6R7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
UtrnE9Q6R7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
UtrnE9Q6R7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
UtrnE9Q6R7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,88■■■□□ 2,37
UtrnE9Q6R7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29,88■■■□□ 2,37
UtrnE9Q6R7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29,87■■■□□ 2,37
UtrnE9Q6R7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
UtrnE9Q6R7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
UtrnE9Q6R7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29,86■■■□□ 2,37
UtrnE9Q6R7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
UtrnE9Q6R7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
UtrnE9Q6R7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
UtrnE9Q6R7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
UtrnE9Q6R7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
UtrnE9Q6R7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
UtrnE9Q6R7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,81■■■□□ 2,36
UtrnE9Q6R7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29,81■■■□□ 2,36
UtrnE9Q6R7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
UtrnE9Q6R7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29,8■■■□□ 2,36
UtrnE9Q6R7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29,8■■■□□ 2,36
UtrnE9Q6R7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,79■■■□□ 2,36
UtrnE9Q6R7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC29,78■■■□□ 2,36
UtrnE9Q6R7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29,78■■■□□ 2,36
UtrnE9Q6R7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
UtrnE9Q6R7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29,77■■■□□ 2,36
UtrnE9Q6R7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29,77■■■□□ 2,36
UtrnE9Q6R7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29,77■■■□□ 2,36
UtrnE9Q6R7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29,77■■■□□ 2,36
UtrnE9Q6R7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29,77■■■□□ 2,36
UtrnE9Q6R7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,36
UtrnE9Q6R7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29,74■■■□□ 2,35
UtrnE9Q6R7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,73■■■□□ 2,35
UtrnE9Q6R7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
UtrnE9Q6R7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
UtrnE9Q6R7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
UtrnE9Q6R7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,8 ms