Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ19

Igsf9b, Protein turtle homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf9bE9PZ19 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Igsf9bE9PZ19 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Igsf9bE9PZ19 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Igsf9bE9PZ19 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Igsf9bE9PZ19 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Igsf9bE9PZ19 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Igsf9bE9PZ19 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Igsf9bE9PZ19 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Igsf9bE9PZ19 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Igsf9bE9PZ19 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Igsf9bE9PZ19 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Igsf9bE9PZ19 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Igsf9bE9PZ19 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Igsf9bE9PZ19 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Igsf9bE9PZ19 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Igsf9bE9PZ19 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Igsf9bE9PZ19 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Igsf9bE9PZ19 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Igsf9bE9PZ19 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Igsf9bE9PZ19 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Igsf9bE9PZ19 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Igsf9bE9PZ19 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Igsf9bE9PZ19 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Igsf9bE9PZ19 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Igsf9bE9PZ19 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Igsf9bE9PZ19 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Igsf9bE9PZ19 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Igsf9bE9PZ19 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Igsf9bE9PZ19 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Igsf9bE9PZ19 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Igsf9bE9PZ19 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Igsf9bE9PZ19 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Igsf9bE9PZ19 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Igsf9bE9PZ19 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Igsf9bE9PZ19 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Igsf9bE9PZ19 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Igsf9bE9PZ19 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Igsf9bE9PZ19 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Igsf9bE9PZ19 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Igsf9bE9PZ19 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Igsf9bE9PZ19 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Igsf9bE9PZ19 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Igsf9bE9PZ19 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Igsf9bE9PZ19 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Igsf9bE9PZ19 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Igsf9bE9PZ19 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Igsf9bE9PZ19 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Igsf9bE9PZ19 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Igsf9bE9PZ19 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Igsf9bE9PZ19 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Igsf9bE9PZ19 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Igsf9bE9PZ19 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Igsf9bE9PZ19 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Igsf9bE9PZ19 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Igsf9bE9PZ19 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Igsf9bE9PZ19 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Igsf9bE9PZ19 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Igsf9bE9PZ19 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Igsf9bE9PZ19 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Igsf9bE9PZ19 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Igsf9bE9PZ19 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Igsf9bE9PZ19 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Igsf9bE9PZ19 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Igsf9bE9PZ19 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Igsf9bE9PZ19 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Igsf9bE9PZ19 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Igsf9bE9PZ19 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Igsf9bE9PZ19 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Igsf9bE9PZ19 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Igsf9bE9PZ19 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Igsf9bE9PZ19 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Igsf9bE9PZ19 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Igsf9bE9PZ19 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Igsf9bE9PZ19 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Igsf9bE9PZ19 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Igsf9bE9PZ19 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Igsf9bE9PZ19 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Igsf9bE9PZ19 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Igsf9bE9PZ19 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Igsf9bE9PZ19 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Igsf9bE9PZ19 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Igsf9bE9PZ19 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Igsf9bE9PZ19 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Igsf9bE9PZ19 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Igsf9bE9PZ19 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Igsf9bE9PZ19 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Igsf9bE9PZ19 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Igsf9bE9PZ19 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Igsf9bE9PZ19 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Igsf9bE9PZ19 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Igsf9bE9PZ19 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Igsf9bE9PZ19 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Igsf9bE9PZ19 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Igsf9bE9PZ19 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Igsf9bE9PZ19 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Igsf9bE9PZ19 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Igsf9bE9PZ19 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Igsf9bE9PZ19 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Igsf9bE9PZ19 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Igsf9bE9PZ19 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms