Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfta2E9PXB6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfta2E9PXB6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfta2E9PXB6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfta2E9PXB6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfta2E9PXB6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sfta2E9PXB6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfta2E9PXB6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfta2E9PXB6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfta2E9PXB6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfta2E9PXB6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfta2E9PXB6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfta2E9PXB6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfta2E9PXB6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfta2E9PXB6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfta2E9PXB6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfta2E9PXB6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfta2E9PXB6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfta2E9PXB6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfta2E9PXB6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfta2E9PXB6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfta2E9PXB6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfta2E9PXB6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfta2E9PXB6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfta2E9PXB6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfta2E9PXB6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfta2E9PXB6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfta2E9PXB6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfta2E9PXB6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfta2E9PXB6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfta2E9PXB6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfta2E9PXB6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfta2E9PXB6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfta2E9PXB6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfta2E9PXB6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfta2E9PXB6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfta2E9PXB6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfta2E9PXB6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfta2E9PXB6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfta2E9PXB6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfta2E9PXB6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfta2E9PXB6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfta2E9PXB6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfta2E9PXB6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfta2E9PXB6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfta2E9PXB6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfta2E9PXB6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfta2E9PXB6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfta2E9PXB6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfta2E9PXB6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfta2E9PXB6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfta2E9PXB6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfta2E9PXB6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfta2E9PXB6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfta2E9PXB6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfta2E9PXB6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfta2E9PXB6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfta2E9PXB6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfta2E9PXB6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfta2E9PXB6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfta2E9PXB6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfta2E9PXB6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfta2E9PXB6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfta2E9PXB6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfta2E9PXB6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfta2E9PXB6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfta2E9PXB6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfta2E9PXB6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sfta2E9PXB6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sfta2E9PXB6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sfta2E9PXB6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfta2E9PXB6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfta2E9PXB6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfta2E9PXB6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfta2E9PXB6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfta2E9PXB6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfta2E9PXB6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfta2E9PXB6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfta2E9PXB6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfta2E9PXB6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfta2E9PXB6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfta2E9PXB6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfta2E9PXB6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfta2E9PXB6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfta2E9PXB6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfta2E9PXB6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfta2E9PXB6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfta2E9PXB6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfta2E9PXB6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfta2E9PXB6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfta2E9PXB6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfta2E9PXB6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfta2E9PXB6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfta2E9PXB6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfta2E9PXB6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sfta2E9PXB6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sfta2E9PXB6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sfta2E9PXB6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sfta2E9PXB6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfta2E9PXB6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms