Protein–RNA interactions for Protein: E9PWH2

Card6, Caspase recruitment domain family, member 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card6E9PWH2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Card6E9PWH2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Card6E9PWH2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Card6E9PWH2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Card6E9PWH2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Card6E9PWH2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Card6E9PWH2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Card6E9PWH2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Card6E9PWH2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Card6E9PWH2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Card6E9PWH2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Card6E9PWH2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Card6E9PWH2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Card6E9PWH2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Card6E9PWH2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Card6E9PWH2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Card6E9PWH2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Card6E9PWH2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Card6E9PWH2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Card6E9PWH2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Card6E9PWH2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Card6E9PWH2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Card6E9PWH2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Card6E9PWH2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Card6E9PWH2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Card6E9PWH2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Card6E9PWH2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Card6E9PWH2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Card6E9PWH2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Card6E9PWH2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Card6E9PWH2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Card6E9PWH2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Card6E9PWH2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Card6E9PWH2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Card6E9PWH2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Card6E9PWH2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Card6E9PWH2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Card6E9PWH2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Card6E9PWH2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Card6E9PWH2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Card6E9PWH2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Card6E9PWH2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Card6E9PWH2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Card6E9PWH2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Card6E9PWH2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Card6E9PWH2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Card6E9PWH2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Card6E9PWH2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Card6E9PWH2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Card6E9PWH2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Card6E9PWH2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Card6E9PWH2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Card6E9PWH2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Card6E9PWH2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Card6E9PWH2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Card6E9PWH2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Card6E9PWH2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Card6E9PWH2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Card6E9PWH2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Card6E9PWH2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Card6E9PWH2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Card6E9PWH2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Card6E9PWH2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Card6E9PWH2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Card6E9PWH2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Card6E9PWH2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Card6E9PWH2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Card6E9PWH2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Card6E9PWH2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Card6E9PWH2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Card6E9PWH2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Card6E9PWH2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Card6E9PWH2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Card6E9PWH2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Card6E9PWH2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Card6E9PWH2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Card6E9PWH2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Card6E9PWH2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Card6E9PWH2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Card6E9PWH2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Card6E9PWH2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Card6E9PWH2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Card6E9PWH2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Card6E9PWH2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Card6E9PWH2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Card6E9PWH2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Card6E9PWH2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Card6E9PWH2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Card6E9PWH2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Card6E9PWH2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Card6E9PWH2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Card6E9PWH2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Card6E9PWH2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Card6E9PWH2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Card6E9PWH2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Card6E9PWH2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Card6E9PWH2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Card6E9PWH2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Card6E9PWH2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Card6E9PWH2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms