Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG6

Ncapg, Non-SMC condensin I complex, subunit G, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcapgE9PWG6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NcapgE9PWG6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NcapgE9PWG6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NcapgE9PWG6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NcapgE9PWG6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NcapgE9PWG6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NcapgE9PWG6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NcapgE9PWG6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NcapgE9PWG6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NcapgE9PWG6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NcapgE9PWG6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NcapgE9PWG6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NcapgE9PWG6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NcapgE9PWG6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NcapgE9PWG6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NcapgE9PWG6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NcapgE9PWG6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NcapgE9PWG6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NcapgE9PWG6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NcapgE9PWG6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NcapgE9PWG6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NcapgE9PWG6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NcapgE9PWG6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NcapgE9PWG6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NcapgE9PWG6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NcapgE9PWG6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NcapgE9PWG6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NcapgE9PWG6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NcapgE9PWG6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NcapgE9PWG6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NcapgE9PWG6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NcapgE9PWG6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NcapgE9PWG6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NcapgE9PWG6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NcapgE9PWG6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NcapgE9PWG6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NcapgE9PWG6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NcapgE9PWG6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NcapgE9PWG6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NcapgE9PWG6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NcapgE9PWG6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NcapgE9PWG6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NcapgE9PWG6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NcapgE9PWG6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NcapgE9PWG6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NcapgE9PWG6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NcapgE9PWG6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NcapgE9PWG6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NcapgE9PWG6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NcapgE9PWG6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NcapgE9PWG6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NcapgE9PWG6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NcapgE9PWG6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NcapgE9PWG6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NcapgE9PWG6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NcapgE9PWG6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NcapgE9PWG6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NcapgE9PWG6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NcapgE9PWG6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NcapgE9PWG6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NcapgE9PWG6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NcapgE9PWG6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NcapgE9PWG6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NcapgE9PWG6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NcapgE9PWG6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NcapgE9PWG6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NcapgE9PWG6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NcapgE9PWG6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NcapgE9PWG6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NcapgE9PWG6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NcapgE9PWG6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NcapgE9PWG6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NcapgE9PWG6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NcapgE9PWG6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NcapgE9PWG6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NcapgE9PWG6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NcapgE9PWG6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NcapgE9PWG6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NcapgE9PWG6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NcapgE9PWG6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NcapgE9PWG6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NcapgE9PWG6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NcapgE9PWG6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NcapgE9PWG6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NcapgE9PWG6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NcapgE9PWG6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NcapgE9PWG6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NcapgE9PWG6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NcapgE9PWG6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NcapgE9PWG6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NcapgE9PWG6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NcapgE9PWG6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NcapgE9PWG6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NcapgE9PWG6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NcapgE9PWG6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NcapgE9PWG6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NcapgE9PWG6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NcapgE9PWG6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NcapgE9PWG6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NcapgE9PWG6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms