Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG6

Ncapg, Non-SMC condensin I complex, subunit G, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcapgE9PWG6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
NcapgE9PWG6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
NcapgE9PWG6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27,53■■■□□ 2
NcapgE9PWG6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
NcapgE9PWG6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27,52■■■□□ 2
NcapgE9PWG6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
NcapgE9PWG6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
NcapgE9PWG6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
NcapgE9PWG6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
NcapgE9PWG6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
NcapgE9PWG6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
NcapgE9PWG6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
NcapgE9PWG6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,48■■□□□ 1,99
NcapgE9PWG6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
NcapgE9PWG6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
NcapgE9PWG6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27,47■■□□□ 1,99
NcapgE9PWG6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
NcapgE9PWG6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,46■■□□□ 1,99
NcapgE9PWG6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,45■■□□□ 1,99
NcapgE9PWG6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27,45■■□□□ 1,98
NcapgE9PWG6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
NcapgE9PWG6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,44■■□□□ 1,98
NcapgE9PWG6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27,44■■□□□ 1,98
NcapgE9PWG6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27,44■■□□□ 1,98
NcapgE9PWG6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
NcapgE9PWG6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
NcapgE9PWG6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
NcapgE9PWG6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
NcapgE9PWG6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,41■■□□□ 1,98
NcapgE9PWG6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,41■■□□□ 1,98
NcapgE9PWG6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
NcapgE9PWG6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,37■■□□□ 1,97
NcapgE9PWG6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
NcapgE9PWG6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
NcapgE9PWG6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
NcapgE9PWG6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
NcapgE9PWG6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
NcapgE9PWG6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
NcapgE9PWG6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
NcapgE9PWG6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
NcapgE9PWG6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
NcapgE9PWG6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27,31■■□□□ 1,96
NcapgE9PWG6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27,31■■□□□ 1,96
NcapgE9PWG6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
NcapgE9PWG6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
NcapgE9PWG6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
NcapgE9PWG6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27,29■■□□□ 1,96
NcapgE9PWG6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
NcapgE9PWG6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
NcapgE9PWG6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
NcapgE9PWG6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
NcapgE9PWG6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
NcapgE9PWG6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
NcapgE9PWG6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
NcapgE9PWG6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
NcapgE9PWG6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
NcapgE9PWG6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,23■■□□□ 1,95
NcapgE9PWG6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
NcapgE9PWG6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
NcapgE9PWG6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27,22■■□□□ 1,95
NcapgE9PWG6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
NcapgE9PWG6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
NcapgE9PWG6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
NcapgE9PWG6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
NcapgE9PWG6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27,17■■□□□ 1,94
NcapgE9PWG6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
NcapgE9PWG6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
NcapgE9PWG6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
NcapgE9PWG6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
NcapgE9PWG6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
NcapgE9PWG6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
NcapgE9PWG6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
NcapgE9PWG6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
NcapgE9PWG6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
NcapgE9PWG6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
NcapgE9PWG6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
NcapgE9PWG6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
NcapgE9PWG6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
NcapgE9PWG6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
NcapgE9PWG6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
NcapgE9PWG6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
NcapgE9PWG6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
NcapgE9PWG6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
NcapgE9PWG6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
NcapgE9PWG6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
NcapgE9PWG6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
NcapgE9PWG6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
NcapgE9PWG6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,07■■□□□ 1,92
NcapgE9PWG6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27,06■■□□□ 1,92
NcapgE9PWG6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,05■■□□□ 1,92
NcapgE9PWG6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
NcapgE9PWG6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
NcapgE9PWG6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
NcapgE9PWG6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
NcapgE9PWG6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
NcapgE9PWG6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
NcapgE9PWG6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
NcapgE9PWG6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,92
NcapgE9PWG6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
NcapgE9PWG6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms