Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ26

Kctd18, Potassium channel tetramerisation domain containing 18, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd18E0CZ26 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kctd18E0CZ26 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kctd18E0CZ26 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Kctd18E0CZ26 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kctd18E0CZ26 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Kctd18E0CZ26 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kctd18E0CZ26 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kctd18E0CZ26 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Kctd18E0CZ26 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Kctd18E0CZ26 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kctd18E0CZ26 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kctd18E0CZ26 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kctd18E0CZ26 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Kctd18E0CZ26 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kctd18E0CZ26 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Kctd18E0CZ26 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Kctd18E0CZ26 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Kctd18E0CZ26 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kctd18E0CZ26 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kctd18E0CZ26 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kctd18E0CZ26 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kctd18E0CZ26 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kctd18E0CZ26 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Kctd18E0CZ26 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Kctd18E0CZ26 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Kctd18E0CZ26 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kctd18E0CZ26 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kctd18E0CZ26 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kctd18E0CZ26 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kctd18E0CZ26 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kctd18E0CZ26 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kctd18E0CZ26 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kctd18E0CZ26 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kctd18E0CZ26 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kctd18E0CZ26 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kctd18E0CZ26 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kctd18E0CZ26 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kctd18E0CZ26 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kctd18E0CZ26 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Kctd18E0CZ26 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kctd18E0CZ26 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Kctd18E0CZ26 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kctd18E0CZ26 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kctd18E0CZ26 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kctd18E0CZ26 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kctd18E0CZ26 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kctd18E0CZ26 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kctd18E0CZ26 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kctd18E0CZ26 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kctd18E0CZ26 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kctd18E0CZ26 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kctd18E0CZ26 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kctd18E0CZ26 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kctd18E0CZ26 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kctd18E0CZ26 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kctd18E0CZ26 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Kctd18E0CZ26 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kctd18E0CZ26 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kctd18E0CZ26 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kctd18E0CZ26 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Kctd18E0CZ26 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kctd18E0CZ26 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kctd18E0CZ26 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kctd18E0CZ26 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kctd18E0CZ26 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kctd18E0CZ26 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kctd18E0CZ26 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kctd18E0CZ26 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kctd18E0CZ26 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Kctd18E0CZ26 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Kctd18E0CZ26 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kctd18E0CZ26 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Kctd18E0CZ26 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kctd18E0CZ26 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kctd18E0CZ26 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kctd18E0CZ26 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kctd18E0CZ26 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kctd18E0CZ26 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kctd18E0CZ26 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kctd18E0CZ26 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kctd18E0CZ26 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Kctd18E0CZ26 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kctd18E0CZ26 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kctd18E0CZ26 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kctd18E0CZ26 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kctd18E0CZ26 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kctd18E0CZ26 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kctd18E0CZ26 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kctd18E0CZ26 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kctd18E0CZ26 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kctd18E0CZ26 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kctd18E0CZ26 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kctd18E0CZ26 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Kctd18E0CZ26 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kctd18E0CZ26 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kctd18E0CZ26 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kctd18E0CZ26 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kctd18E0CZ26 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kctd18E0CZ26 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kctd18E0CZ26 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms