Protein–RNA interactions for Protein: D6MZJ6

Smpd5, MCG22096, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd5D6MZJ6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smpd5D6MZJ6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smpd5D6MZJ6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smpd5D6MZJ6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smpd5D6MZJ6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smpd5D6MZJ6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smpd5D6MZJ6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smpd5D6MZJ6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smpd5D6MZJ6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smpd5D6MZJ6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smpd5D6MZJ6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Smpd5D6MZJ6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smpd5D6MZJ6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smpd5D6MZJ6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smpd5D6MZJ6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smpd5D6MZJ6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smpd5D6MZJ6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smpd5D6MZJ6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smpd5D6MZJ6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smpd5D6MZJ6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smpd5D6MZJ6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smpd5D6MZJ6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smpd5D6MZJ6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smpd5D6MZJ6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smpd5D6MZJ6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smpd5D6MZJ6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smpd5D6MZJ6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Smpd5D6MZJ6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smpd5D6MZJ6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smpd5D6MZJ6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Smpd5D6MZJ6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smpd5D6MZJ6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smpd5D6MZJ6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smpd5D6MZJ6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smpd5D6MZJ6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smpd5D6MZJ6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smpd5D6MZJ6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smpd5D6MZJ6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smpd5D6MZJ6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Smpd5D6MZJ6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smpd5D6MZJ6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smpd5D6MZJ6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smpd5D6MZJ6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smpd5D6MZJ6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smpd5D6MZJ6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Smpd5D6MZJ6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smpd5D6MZJ6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smpd5D6MZJ6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smpd5D6MZJ6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smpd5D6MZJ6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smpd5D6MZJ6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Smpd5D6MZJ6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smpd5D6MZJ6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smpd5D6MZJ6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smpd5D6MZJ6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smpd5D6MZJ6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smpd5D6MZJ6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smpd5D6MZJ6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smpd5D6MZJ6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smpd5D6MZJ6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smpd5D6MZJ6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smpd5D6MZJ6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smpd5D6MZJ6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smpd5D6MZJ6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smpd5D6MZJ6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smpd5D6MZJ6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smpd5D6MZJ6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smpd5D6MZJ6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smpd5D6MZJ6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smpd5D6MZJ6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Smpd5D6MZJ6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Smpd5D6MZJ6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smpd5D6MZJ6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smpd5D6MZJ6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smpd5D6MZJ6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smpd5D6MZJ6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smpd5D6MZJ6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smpd5D6MZJ6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smpd5D6MZJ6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smpd5D6MZJ6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smpd5D6MZJ6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smpd5D6MZJ6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smpd5D6MZJ6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smpd5D6MZJ6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smpd5D6MZJ6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smpd5D6MZJ6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Smpd5D6MZJ6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smpd5D6MZJ6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smpd5D6MZJ6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Smpd5D6MZJ6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smpd5D6MZJ6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smpd5D6MZJ6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smpd5D6MZJ6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smpd5D6MZJ6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smpd5D6MZJ6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smpd5D6MZJ6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smpd5D6MZJ6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smpd5D6MZJ6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smpd5D6MZJ6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smpd5D6MZJ6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms