Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vpreb3D3Z6J4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vpreb3D3Z6J4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vpreb3D3Z6J4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vpreb3D3Z6J4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vpreb3D3Z6J4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vpreb3D3Z6J4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vpreb3D3Z6J4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vpreb3D3Z6J4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vpreb3D3Z6J4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vpreb3D3Z6J4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vpreb3D3Z6J4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vpreb3D3Z6J4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vpreb3D3Z6J4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vpreb3D3Z6J4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vpreb3D3Z6J4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vpreb3D3Z6J4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vpreb3D3Z6J4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vpreb3D3Z6J4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vpreb3D3Z6J4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vpreb3D3Z6J4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vpreb3D3Z6J4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vpreb3D3Z6J4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vpreb3D3Z6J4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vpreb3D3Z6J4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vpreb3D3Z6J4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vpreb3D3Z6J4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vpreb3D3Z6J4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vpreb3D3Z6J4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vpreb3D3Z6J4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vpreb3D3Z6J4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vpreb3D3Z6J4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vpreb3D3Z6J4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vpreb3D3Z6J4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vpreb3D3Z6J4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vpreb3D3Z6J4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vpreb3D3Z6J4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vpreb3D3Z6J4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vpreb3D3Z6J4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vpreb3D3Z6J4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vpreb3D3Z6J4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vpreb3D3Z6J4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vpreb3D3Z6J4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vpreb3D3Z6J4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vpreb3D3Z6J4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vpreb3D3Z6J4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vpreb3D3Z6J4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vpreb3D3Z6J4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vpreb3D3Z6J4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vpreb3D3Z6J4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vpreb3D3Z6J4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vpreb3D3Z6J4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vpreb3D3Z6J4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vpreb3D3Z6J4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vpreb3D3Z6J4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vpreb3D3Z6J4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vpreb3D3Z6J4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vpreb3D3Z6J4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vpreb3D3Z6J4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vpreb3D3Z6J4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vpreb3D3Z6J4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vpreb3D3Z6J4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vpreb3D3Z6J4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vpreb3D3Z6J4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vpreb3D3Z6J4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vpreb3D3Z6J4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vpreb3D3Z6J4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vpreb3D3Z6J4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vpreb3D3Z6J4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vpreb3D3Z6J4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vpreb3D3Z6J4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vpreb3D3Z6J4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vpreb3D3Z6J4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vpreb3D3Z6J4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vpreb3D3Z6J4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vpreb3D3Z6J4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vpreb3D3Z6J4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vpreb3D3Z6J4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vpreb3D3Z6J4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vpreb3D3Z6J4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vpreb3D3Z6J4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vpreb3D3Z6J4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vpreb3D3Z6J4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vpreb3D3Z6J4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vpreb3D3Z6J4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vpreb3D3Z6J4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vpreb3D3Z6J4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vpreb3D3Z6J4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vpreb3D3Z6J4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vpreb3D3Z6J4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vpreb3D3Z6J4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vpreb3D3Z6J4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vpreb3D3Z6J4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vpreb3D3Z6J4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vpreb3D3Z6J4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vpreb3D3Z6J4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vpreb3D3Z6J4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vpreb3D3Z6J4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms