Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3M1

Vmn2r125, Vomeronasal 2, receptor 125, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r125D3Z3M1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vmn2r125D3Z3M1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn2r125D3Z3M1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn2r125D3Z3M1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn2r125D3Z3M1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn2r125D3Z3M1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn2r125D3Z3M1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn2r125D3Z3M1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn2r125D3Z3M1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn2r125D3Z3M1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn2r125D3Z3M1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn2r125D3Z3M1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn2r125D3Z3M1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn2r125D3Z3M1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn2r125D3Z3M1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn2r125D3Z3M1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Vmn2r125D3Z3M1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn2r125D3Z3M1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn2r125D3Z3M1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn2r125D3Z3M1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn2r125D3Z3M1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn2r125D3Z3M1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn2r125D3Z3M1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn2r125D3Z3M1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn2r125D3Z3M1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn2r125D3Z3M1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn2r125D3Z3M1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn2r125D3Z3M1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn2r125D3Z3M1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vmn2r125D3Z3M1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vmn2r125D3Z3M1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn2r125D3Z3M1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn2r125D3Z3M1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn2r125D3Z3M1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn2r125D3Z3M1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn2r125D3Z3M1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn2r125D3Z3M1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn2r125D3Z3M1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn2r125D3Z3M1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn2r125D3Z3M1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn2r125D3Z3M1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn2r125D3Z3M1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn2r125D3Z3M1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn2r125D3Z3M1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn2r125D3Z3M1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn2r125D3Z3M1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn2r125D3Z3M1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn2r125D3Z3M1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn2r125D3Z3M1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn2r125D3Z3M1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn2r125D3Z3M1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn2r125D3Z3M1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn2r125D3Z3M1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn2r125D3Z3M1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn2r125D3Z3M1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn2r125D3Z3M1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn2r125D3Z3M1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn2r125D3Z3M1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn2r125D3Z3M1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn2r125D3Z3M1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn2r125D3Z3M1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn2r125D3Z3M1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn2r125D3Z3M1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn2r125D3Z3M1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn2r125D3Z3M1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn2r125D3Z3M1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vmn2r125D3Z3M1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn2r125D3Z3M1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn2r125D3Z3M1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn2r125D3Z3M1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn2r125D3Z3M1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn2r125D3Z3M1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn2r125D3Z3M1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn2r125D3Z3M1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn2r125D3Z3M1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn2r125D3Z3M1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn2r125D3Z3M1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn2r125D3Z3M1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn2r125D3Z3M1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn2r125D3Z3M1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn2r125D3Z3M1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn2r125D3Z3M1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn2r125D3Z3M1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn2r125D3Z3M1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn2r125D3Z3M1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn2r125D3Z3M1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn2r125D3Z3M1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn2r125D3Z3M1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn2r125D3Z3M1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r125D3Z3M1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r125D3Z3M1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r125D3Z3M1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn2r125D3Z3M1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn2r125D3Z3M1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn2r125D3Z3M1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn2r125D3Z3M1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn2r125D3Z3M1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn2r125D3Z3M1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn2r125D3Z3M1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn2r125D3Z3M1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms