Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cspp1B2RX88 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cspp1B2RX88 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Cspp1B2RX88 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cspp1B2RX88 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cspp1B2RX88 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cspp1B2RX88 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cspp1B2RX88 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cspp1B2RX88 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cspp1B2RX88 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cspp1B2RX88 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cspp1B2RX88 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cspp1B2RX88 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cspp1B2RX88 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cspp1B2RX88 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cspp1B2RX88 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cspp1B2RX88 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cspp1B2RX88 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cspp1B2RX88 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cspp1B2RX88 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cspp1B2RX88 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cspp1B2RX88 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cspp1B2RX88 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Cspp1B2RX88 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cspp1B2RX88 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cspp1B2RX88 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cspp1B2RX88 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cspp1B2RX88 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cspp1B2RX88 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cspp1B2RX88 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cspp1B2RX88 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cspp1B2RX88 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cspp1B2RX88 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Cspp1B2RX88 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Cspp1B2RX88 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cspp1B2RX88 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cspp1B2RX88 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cspp1B2RX88 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cspp1B2RX88 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cspp1B2RX88 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cspp1B2RX88 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cspp1B2RX88 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cspp1B2RX88 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cspp1B2RX88 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cspp1B2RX88 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cspp1B2RX88 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cspp1B2RX88 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cspp1B2RX88 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cspp1B2RX88 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cspp1B2RX88 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cspp1B2RX88 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Cspp1B2RX88 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cspp1B2RX88 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cspp1B2RX88 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cspp1B2RX88 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cspp1B2RX88 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Cspp1B2RX88 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cspp1B2RX88 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cspp1B2RX88 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cspp1B2RX88 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cspp1B2RX88 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cspp1B2RX88 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cspp1B2RX88 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cspp1B2RX88 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cspp1B2RX88 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cspp1B2RX88 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cspp1B2RX88 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cspp1B2RX88 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Cspp1B2RX88 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cspp1B2RX88 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cspp1B2RX88 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cspp1B2RX88 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cspp1B2RX88 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cspp1B2RX88 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cspp1B2RX88 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cspp1B2RX88 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cspp1B2RX88 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cspp1B2RX88 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cspp1B2RX88 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cspp1B2RX88 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cspp1B2RX88 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cspp1B2RX88 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Cspp1B2RX88 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cspp1B2RX88 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cspp1B2RX88 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cspp1B2RX88 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cspp1B2RX88 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cspp1B2RX88 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cspp1B2RX88 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cspp1B2RX88 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cspp1B2RX88 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cspp1B2RX88 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cspp1B2RX88 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cspp1B2RX88 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cspp1B2RX88 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cspp1B2RX88 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cspp1B2RX88 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cspp1B2RX88 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cspp1B2RX88 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cspp1B2RX88 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms