Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm5483B2RV77 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm5483B2RV77 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gm5483B2RV77 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gm5483B2RV77 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm5483B2RV77 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm5483B2RV77 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm5483B2RV77 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm5483B2RV77 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm5483B2RV77 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm5483B2RV77 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gm5483B2RV77 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Gm5483B2RV77 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm5483B2RV77 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm5483B2RV77 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm5483B2RV77 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm5483B2RV77 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm5483B2RV77 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm5483B2RV77 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm5483B2RV77 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm5483B2RV77 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm5483B2RV77 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm5483B2RV77 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm5483B2RV77 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm5483B2RV77 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gm5483B2RV77 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Gm5483B2RV77 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gm5483B2RV77 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm5483B2RV77 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm5483B2RV77 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm5483B2RV77 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm5483B2RV77 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm5483B2RV77 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm5483B2RV77 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm5483B2RV77 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Gm5483B2RV77 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gm5483B2RV77 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gm5483B2RV77 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gm5483B2RV77 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gm5483B2RV77 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gm5483B2RV77 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gm5483B2RV77 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gm5483B2RV77 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gm5483B2RV77 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gm5483B2RV77 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gm5483B2RV77 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Gm5483B2RV77 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gm5483B2RV77 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gm5483B2RV77 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gm5483B2RV77 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gm5483B2RV77 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gm5483B2RV77 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gm5483B2RV77 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gm5483B2RV77 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gm5483B2RV77 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gm5483B2RV77 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm5483B2RV77 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm5483B2RV77 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Gm5483B2RV77 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gm5483B2RV77 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Gm5483B2RV77 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Gm5483B2RV77 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Gm5483B2RV77 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gm5483B2RV77 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm5483B2RV77 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm5483B2RV77 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm5483B2RV77 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm5483B2RV77 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm5483B2RV77 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm5483B2RV77 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm5483B2RV77 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm5483B2RV77 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm5483B2RV77 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm5483B2RV77 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm5483B2RV77 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm5483B2RV77 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm5483B2RV77 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm5483B2RV77 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm5483B2RV77 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm5483B2RV77 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm5483B2RV77 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm5483B2RV77 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm5483B2RV77 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm5483B2RV77 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm5483B2RV77 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm5483B2RV77 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm5483B2RV77 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm5483B2RV77 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm5483B2RV77 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm5483B2RV77 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm5483B2RV77 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm5483B2RV77 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm5483B2RV77 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm5483B2RV77 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm5483B2RV77 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm5483B2RV77 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm5483B2RV77 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm5483B2RV77 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm5483B2RV77 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm5483B2RV77 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms