Protein–RNA interactions for Protein: B2RRL2

Jrkl, Jerky protein homolog-like, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrklB2RRL2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
JrklB2RRL2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
JrklB2RRL2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
JrklB2RRL2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
JrklB2RRL2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
JrklB2RRL2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
JrklB2RRL2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
JrklB2RRL2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
JrklB2RRL2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
JrklB2RRL2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
JrklB2RRL2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
JrklB2RRL2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
JrklB2RRL2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
JrklB2RRL2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
JrklB2RRL2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
JrklB2RRL2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
JrklB2RRL2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
JrklB2RRL2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
JrklB2RRL2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
JrklB2RRL2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
JrklB2RRL2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
JrklB2RRL2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
JrklB2RRL2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
JrklB2RRL2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
JrklB2RRL2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
JrklB2RRL2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
JrklB2RRL2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
JrklB2RRL2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
JrklB2RRL2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
JrklB2RRL2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
JrklB2RRL2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
JrklB2RRL2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
JrklB2RRL2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
JrklB2RRL2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
JrklB2RRL2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
JrklB2RRL2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
JrklB2RRL2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
JrklB2RRL2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
JrklB2RRL2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
JrklB2RRL2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
JrklB2RRL2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
JrklB2RRL2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
JrklB2RRL2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
JrklB2RRL2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
JrklB2RRL2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
JrklB2RRL2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
JrklB2RRL2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
JrklB2RRL2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
JrklB2RRL2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
JrklB2RRL2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
JrklB2RRL2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
JrklB2RRL2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
JrklB2RRL2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
JrklB2RRL2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
JrklB2RRL2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
JrklB2RRL2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
JrklB2RRL2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
JrklB2RRL2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
JrklB2RRL2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
JrklB2RRL2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
JrklB2RRL2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
JrklB2RRL2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
JrklB2RRL2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
JrklB2RRL2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
JrklB2RRL2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
JrklB2RRL2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
JrklB2RRL2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
JrklB2RRL2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
JrklB2RRL2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
JrklB2RRL2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
JrklB2RRL2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
JrklB2RRL2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
JrklB2RRL2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
JrklB2RRL2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
JrklB2RRL2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
JrklB2RRL2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
JrklB2RRL2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
JrklB2RRL2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
JrklB2RRL2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
JrklB2RRL2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
JrklB2RRL2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
JrklB2RRL2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
JrklB2RRL2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
JrklB2RRL2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
JrklB2RRL2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
JrklB2RRL2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
JrklB2RRL2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
JrklB2RRL2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
JrklB2RRL2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
JrklB2RRL2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
JrklB2RRL2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
JrklB2RRL2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
JrklB2RRL2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
JrklB2RRL2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
JrklB2RRL2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
JrklB2RRL2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
JrklB2RRL2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
JrklB2RRL2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
JrklB2RRL2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
JrklB2RRL2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms