Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CK137956B1AYM9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CK137956B1AYM9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CK137956B1AYM9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CK137956B1AYM9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CK137956B1AYM9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CK137956B1AYM9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CK137956B1AYM9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CK137956B1AYM9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CK137956B1AYM9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CK137956B1AYM9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CK137956B1AYM9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CK137956B1AYM9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CK137956B1AYM9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CK137956B1AYM9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CK137956B1AYM9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CK137956B1AYM9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CK137956B1AYM9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CK137956B1AYM9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CK137956B1AYM9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CK137956B1AYM9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CK137956B1AYM9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CK137956B1AYM9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CK137956B1AYM9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CK137956B1AYM9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CK137956B1AYM9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CK137956B1AYM9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CK137956B1AYM9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CK137956B1AYM9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CK137956B1AYM9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CK137956B1AYM9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CK137956B1AYM9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CK137956B1AYM9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CK137956B1AYM9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CK137956B1AYM9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CK137956B1AYM9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CK137956B1AYM9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CK137956B1AYM9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CK137956B1AYM9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CK137956B1AYM9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CK137956B1AYM9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CK137956B1AYM9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CK137956B1AYM9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CK137956B1AYM9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CK137956B1AYM9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CK137956B1AYM9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CK137956B1AYM9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CK137956B1AYM9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CK137956B1AYM9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CK137956B1AYM9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CK137956B1AYM9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CK137956B1AYM9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CK137956B1AYM9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CK137956B1AYM9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CK137956B1AYM9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CK137956B1AYM9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CK137956B1AYM9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CK137956B1AYM9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CK137956B1AYM9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CK137956B1AYM9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CK137956B1AYM9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CK137956B1AYM9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CK137956B1AYM9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CK137956B1AYM9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CK137956B1AYM9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CK137956B1AYM9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CK137956B1AYM9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CK137956B1AYM9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CK137956B1AYM9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CK137956B1AYM9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CK137956B1AYM9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CK137956B1AYM9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CK137956B1AYM9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CK137956B1AYM9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CK137956B1AYM9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CK137956B1AYM9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CK137956B1AYM9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CK137956B1AYM9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CK137956B1AYM9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CK137956B1AYM9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CK137956B1AYM9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CK137956B1AYM9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CK137956B1AYM9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CK137956B1AYM9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CK137956B1AYM9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CK137956B1AYM9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CK137956B1AYM9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CK137956B1AYM9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CK137956B1AYM9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CK137956B1AYM9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CK137956B1AYM9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CK137956B1AYM9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CK137956B1AYM9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CK137956B1AYM9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CK137956B1AYM9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CK137956B1AYM9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CK137956B1AYM9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CK137956B1AYM9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CK137956B1AYM9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CK137956B1AYM9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms