Protein–RNA interactions for Protein: B1AUC4

Ube2u, Ubiquitin-conjugating enzyme E2U (putative), mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2uB1AUC4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Ube2uB1AUC4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
Ube2uB1AUC4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Ube2uB1AUC4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Ube2uB1AUC4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ube2uB1AUC4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ube2uB1AUC4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Ube2uB1AUC4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Ube2uB1AUC4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Ube2uB1AUC4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Ube2uB1AUC4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Ube2uB1AUC4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Ube2uB1AUC4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Ube2uB1AUC4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Ube2uB1AUC4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Ube2uB1AUC4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Ube2uB1AUC4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Ube2uB1AUC4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Ube2uB1AUC4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
Ube2uB1AUC4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Ube2uB1AUC4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Ube2uB1AUC4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ube2uB1AUC4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ube2uB1AUC4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ube2uB1AUC4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ube2uB1AUC4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ube2uB1AUC4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Ube2uB1AUC4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Ube2uB1AUC4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Ube2uB1AUC4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Ube2uB1AUC4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Ube2uB1AUC4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Ube2uB1AUC4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Ube2uB1AUC4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Ube2uB1AUC4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Ube2uB1AUC4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Ube2uB1AUC4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Ube2uB1AUC4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Ube2uB1AUC4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Ube2uB1AUC4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Ube2uB1AUC4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Ube2uB1AUC4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Ube2uB1AUC4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Ube2uB1AUC4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Ube2uB1AUC4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
Ube2uB1AUC4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ube2uB1AUC4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ube2uB1AUC4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Ube2uB1AUC4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Ube2uB1AUC4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Ube2uB1AUC4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Ube2uB1AUC4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Ube2uB1AUC4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Ube2uB1AUC4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
Ube2uB1AUC4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Ube2uB1AUC4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Ube2uB1AUC4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Ube2uB1AUC4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ube2uB1AUC4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Ube2uB1AUC4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Ube2uB1AUC4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Ube2uB1AUC4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
Ube2uB1AUC4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Ube2uB1AUC4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Ube2uB1AUC4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Ube2uB1AUC4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Ube2uB1AUC4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
Ube2uB1AUC4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Ube2uB1AUC4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Ube2uB1AUC4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Ube2uB1AUC4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Ube2uB1AUC4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Ube2uB1AUC4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Ube2uB1AUC4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ube2uB1AUC4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ube2uB1AUC4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Ube2uB1AUC4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
Ube2uB1AUC4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ube2uB1AUC4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ube2uB1AUC4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
Ube2uB1AUC4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Ube2uB1AUC4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ube2uB1AUC4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ube2uB1AUC4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ube2uB1AUC4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Ube2uB1AUC4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Ube2uB1AUC4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Ube2uB1AUC4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ube2uB1AUC4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Ube2uB1AUC4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Ube2uB1AUC4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ube2uB1AUC4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
Ube2uB1AUC4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Ube2uB1AUC4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Ube2uB1AUC4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
Ube2uB1AUC4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Ube2uB1AUC4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Ube2uB1AUC4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Ube2uB1AUC4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Ube2uB1AUC4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms