Protein–RNA interactions for Protein: A9Z1V5

Vwa5b1, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B1, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5b1A9Z1V5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vwa5b1A9Z1V5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vwa5b1A9Z1V5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vwa5b1A9Z1V5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vwa5b1A9Z1V5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vwa5b1A9Z1V5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vwa5b1A9Z1V5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vwa5b1A9Z1V5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vwa5b1A9Z1V5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vwa5b1A9Z1V5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vwa5b1A9Z1V5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vwa5b1A9Z1V5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vwa5b1A9Z1V5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vwa5b1A9Z1V5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vwa5b1A9Z1V5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vwa5b1A9Z1V5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vwa5b1A9Z1V5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vwa5b1A9Z1V5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vwa5b1A9Z1V5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vwa5b1A9Z1V5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vwa5b1A9Z1V5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vwa5b1A9Z1V5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vwa5b1A9Z1V5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vwa5b1A9Z1V5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vwa5b1A9Z1V5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vwa5b1A9Z1V5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vwa5b1A9Z1V5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vwa5b1A9Z1V5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vwa5b1A9Z1V5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vwa5b1A9Z1V5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vwa5b1A9Z1V5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vwa5b1A9Z1V5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vwa5b1A9Z1V5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vwa5b1A9Z1V5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vwa5b1A9Z1V5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vwa5b1A9Z1V5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vwa5b1A9Z1V5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vwa5b1A9Z1V5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vwa5b1A9Z1V5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Vwa5b1A9Z1V5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vwa5b1A9Z1V5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vwa5b1A9Z1V5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vwa5b1A9Z1V5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vwa5b1A9Z1V5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vwa5b1A9Z1V5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vwa5b1A9Z1V5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vwa5b1A9Z1V5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vwa5b1A9Z1V5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vwa5b1A9Z1V5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vwa5b1A9Z1V5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vwa5b1A9Z1V5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vwa5b1A9Z1V5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vwa5b1A9Z1V5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vwa5b1A9Z1V5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vwa5b1A9Z1V5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Vwa5b1A9Z1V5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vwa5b1A9Z1V5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vwa5b1A9Z1V5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Vwa5b1A9Z1V5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vwa5b1A9Z1V5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vwa5b1A9Z1V5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vwa5b1A9Z1V5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vwa5b1A9Z1V5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Vwa5b1A9Z1V5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vwa5b1A9Z1V5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vwa5b1A9Z1V5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vwa5b1A9Z1V5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Vwa5b1A9Z1V5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vwa5b1A9Z1V5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vwa5b1A9Z1V5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vwa5b1A9Z1V5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Vwa5b1A9Z1V5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vwa5b1A9Z1V5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vwa5b1A9Z1V5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vwa5b1A9Z1V5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vwa5b1A9Z1V5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vwa5b1A9Z1V5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vwa5b1A9Z1V5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vwa5b1A9Z1V5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vwa5b1A9Z1V5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vwa5b1A9Z1V5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vwa5b1A9Z1V5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vwa5b1A9Z1V5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vwa5b1A9Z1V5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vwa5b1A9Z1V5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vwa5b1A9Z1V5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vwa5b1A9Z1V5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vwa5b1A9Z1V5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Vwa5b1A9Z1V5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vwa5b1A9Z1V5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vwa5b1A9Z1V5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vwa5b1A9Z1V5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vwa5b1A9Z1V5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vwa5b1A9Z1V5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vwa5b1A9Z1V5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vwa5b1A9Z1V5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vwa5b1A9Z1V5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vwa5b1A9Z1V5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vwa5b1A9Z1V5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vwa5b1A9Z1V5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms