Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem238A9JSM3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem238A9JSM3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem238A9JSM3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem238A9JSM3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem238A9JSM3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem238A9JSM3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem238A9JSM3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem238A9JSM3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem238A9JSM3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem238A9JSM3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem238A9JSM3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem238A9JSM3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem238A9JSM3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem238A9JSM3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem238A9JSM3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem238A9JSM3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem238A9JSM3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem238A9JSM3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem238A9JSM3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem238A9JSM3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem238A9JSM3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem238A9JSM3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem238A9JSM3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem238A9JSM3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem238A9JSM3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem238A9JSM3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem238A9JSM3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem238A9JSM3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem238A9JSM3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem238A9JSM3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem238A9JSM3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem238A9JSM3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem238A9JSM3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem238A9JSM3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem238A9JSM3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem238A9JSM3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem238A9JSM3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem238A9JSM3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem238A9JSM3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem238A9JSM3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem238A9JSM3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem238A9JSM3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem238A9JSM3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem238A9JSM3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem238A9JSM3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem238A9JSM3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem238A9JSM3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem238A9JSM3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem238A9JSM3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem238A9JSM3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem238A9JSM3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem238A9JSM3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem238A9JSM3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem238A9JSM3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem238A9JSM3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem238A9JSM3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem238A9JSM3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem238A9JSM3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem238A9JSM3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem238A9JSM3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem238A9JSM3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem238A9JSM3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem238A9JSM3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem238A9JSM3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem238A9JSM3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem238A9JSM3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem238A9JSM3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem238A9JSM3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem238A9JSM3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem238A9JSM3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem238A9JSM3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem238A9JSM3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem238A9JSM3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem238A9JSM3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem238A9JSM3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem238A9JSM3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem238A9JSM3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem238A9JSM3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem238A9JSM3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem238A9JSM3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem238A9JSM3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem238A9JSM3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem238A9JSM3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem238A9JSM3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem238A9JSM3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem238A9JSM3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem238A9JSM3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem238A9JSM3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem238A9JSM3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem238A9JSM3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem238A9JSM3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem238A9JSM3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem238A9JSM3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem238A9JSM3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tmem238A9JSM3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem238A9JSM3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem238A9JSM3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem238A9JSM3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem238A9JSM3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 537.7 ms