Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttll11A4Q9F4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttll11A4Q9F4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttll11A4Q9F4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttll11A4Q9F4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttll11A4Q9F4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ttll11A4Q9F4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttll11A4Q9F4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttll11A4Q9F4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttll11A4Q9F4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttll11A4Q9F4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttll11A4Q9F4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttll11A4Q9F4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttll11A4Q9F4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttll11A4Q9F4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttll11A4Q9F4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttll11A4Q9F4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttll11A4Q9F4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttll11A4Q9F4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttll11A4Q9F4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttll11A4Q9F4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttll11A4Q9F4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttll11A4Q9F4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttll11A4Q9F4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttll11A4Q9F4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttll11A4Q9F4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttll11A4Q9F4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttll11A4Q9F4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttll11A4Q9F4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttll11A4Q9F4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttll11A4Q9F4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttll11A4Q9F4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttll11A4Q9F4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ttll11A4Q9F4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttll11A4Q9F4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttll11A4Q9F4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttll11A4Q9F4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttll11A4Q9F4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttll11A4Q9F4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttll11A4Q9F4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttll11A4Q9F4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttll11A4Q9F4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttll11A4Q9F4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttll11A4Q9F4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttll11A4Q9F4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttll11A4Q9F4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttll11A4Q9F4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttll11A4Q9F4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttll11A4Q9F4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttll11A4Q9F4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttll11A4Q9F4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttll11A4Q9F4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttll11A4Q9F4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttll11A4Q9F4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttll11A4Q9F4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttll11A4Q9F4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ttll11A4Q9F4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttll11A4Q9F4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttll11A4Q9F4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttll11A4Q9F4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttll11A4Q9F4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttll11A4Q9F4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ttll11A4Q9F4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttll11A4Q9F4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttll11A4Q9F4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttll11A4Q9F4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttll11A4Q9F4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ttll11A4Q9F4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttll11A4Q9F4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttll11A4Q9F4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttll11A4Q9F4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttll11A4Q9F4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttll11A4Q9F4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttll11A4Q9F4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttll11A4Q9F4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ttll11A4Q9F4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ttll11A4Q9F4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ttll11A4Q9F4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ttll11A4Q9F4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ttll11A4Q9F4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttll11A4Q9F4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttll11A4Q9F4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttll11A4Q9F4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttll11A4Q9F4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttll11A4Q9F4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttll11A4Q9F4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ttll11A4Q9F4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ttll11A4Q9F4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ttll11A4Q9F4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ttll11A4Q9F4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttll11A4Q9F4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttll11A4Q9F4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttll11A4Q9F4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttll11A4Q9F4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttll11A4Q9F4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ttll11A4Q9F4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ttll11A4Q9F4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ttll11A4Q9F4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ttll11A4Q9F4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ttll11A4Q9F4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms