Protein–RNA interactions for Protein: A2AR95

Ldlrad3, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad3A2AR95 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ldlrad3A2AR95 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ldlrad3A2AR95 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ldlrad3A2AR95 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ldlrad3A2AR95 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ldlrad3A2AR95 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Ldlrad3A2AR95 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ldlrad3A2AR95 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ldlrad3A2AR95 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ldlrad3A2AR95 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ldlrad3A2AR95 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ldlrad3A2AR95 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ldlrad3A2AR95 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ldlrad3A2AR95 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ldlrad3A2AR95 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ldlrad3A2AR95 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ldlrad3A2AR95 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ldlrad3A2AR95 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ldlrad3A2AR95 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ldlrad3A2AR95 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ldlrad3A2AR95 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ldlrad3A2AR95 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ldlrad3A2AR95 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ldlrad3A2AR95 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ldlrad3A2AR95 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ldlrad3A2AR95 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ldlrad3A2AR95 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ldlrad3A2AR95 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ldlrad3A2AR95 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ldlrad3A2AR95 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ldlrad3A2AR95 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ldlrad3A2AR95 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ldlrad3A2AR95 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ldlrad3A2AR95 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ldlrad3A2AR95 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ldlrad3A2AR95 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ldlrad3A2AR95 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ldlrad3A2AR95 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ldlrad3A2AR95 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ldlrad3A2AR95 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ldlrad3A2AR95 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ldlrad3A2AR95 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ldlrad3A2AR95 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ldlrad3A2AR95 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ldlrad3A2AR95 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ldlrad3A2AR95 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ldlrad3A2AR95 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ldlrad3A2AR95 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ldlrad3A2AR95 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ldlrad3A2AR95 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ldlrad3A2AR95 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ldlrad3A2AR95 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ldlrad3A2AR95 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ldlrad3A2AR95 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ldlrad3A2AR95 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ldlrad3A2AR95 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ldlrad3A2AR95 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ldlrad3A2AR95 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ldlrad3A2AR95 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ldlrad3A2AR95 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ldlrad3A2AR95 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ldlrad3A2AR95 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ldlrad3A2AR95 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ldlrad3A2AR95 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ldlrad3A2AR95 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ldlrad3A2AR95 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ldlrad3A2AR95 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ldlrad3A2AR95 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ldlrad3A2AR95 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ldlrad3A2AR95 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ldlrad3A2AR95 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ldlrad3A2AR95 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ldlrad3A2AR95 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ldlrad3A2AR95 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ldlrad3A2AR95 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ldlrad3A2AR95 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ldlrad3A2AR95 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ldlrad3A2AR95 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ldlrad3A2AR95 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ldlrad3A2AR95 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ldlrad3A2AR95 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ldlrad3A2AR95 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ldlrad3A2AR95 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ldlrad3A2AR95 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ldlrad3A2AR95 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ldlrad3A2AR95 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ldlrad3A2AR95 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ldlrad3A2AR95 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ldlrad3A2AR95 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ldlrad3A2AR95 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ldlrad3A2AR95 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ldlrad3A2AR95 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ldlrad3A2AR95 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ldlrad3A2AR95 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ldlrad3A2AR95 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ldlrad3A2AR95 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ldlrad3A2AR95 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ldlrad3A2AR95 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ldlrad3A2AR95 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ldlrad3A2AR95 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms