Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hacd4A2AKM2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hacd4A2AKM2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hacd4A2AKM2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hacd4A2AKM2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hacd4A2AKM2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hacd4A2AKM2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Hacd4A2AKM2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hacd4A2AKM2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hacd4A2AKM2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hacd4A2AKM2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Hacd4A2AKM2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hacd4A2AKM2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hacd4A2AKM2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hacd4A2AKM2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hacd4A2AKM2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hacd4A2AKM2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hacd4A2AKM2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hacd4A2AKM2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hacd4A2AKM2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hacd4A2AKM2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hacd4A2AKM2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hacd4A2AKM2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hacd4A2AKM2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hacd4A2AKM2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hacd4A2AKM2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hacd4A2AKM2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hacd4A2AKM2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hacd4A2AKM2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hacd4A2AKM2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hacd4A2AKM2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hacd4A2AKM2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hacd4A2AKM2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hacd4A2AKM2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hacd4A2AKM2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hacd4A2AKM2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hacd4A2AKM2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hacd4A2AKM2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hacd4A2AKM2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hacd4A2AKM2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hacd4A2AKM2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Hacd4A2AKM2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hacd4A2AKM2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hacd4A2AKM2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hacd4A2AKM2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hacd4A2AKM2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hacd4A2AKM2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hacd4A2AKM2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hacd4A2AKM2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hacd4A2AKM2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hacd4A2AKM2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hacd4A2AKM2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hacd4A2AKM2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hacd4A2AKM2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hacd4A2AKM2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hacd4A2AKM2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hacd4A2AKM2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hacd4A2AKM2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hacd4A2AKM2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Hacd4A2AKM2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hacd4A2AKM2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hacd4A2AKM2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hacd4A2AKM2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hacd4A2AKM2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hacd4A2AKM2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hacd4A2AKM2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hacd4A2AKM2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hacd4A2AKM2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hacd4A2AKM2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hacd4A2AKM2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hacd4A2AKM2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hacd4A2AKM2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hacd4A2AKM2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Hacd4A2AKM2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hacd4A2AKM2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hacd4A2AKM2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hacd4A2AKM2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hacd4A2AKM2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hacd4A2AKM2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Hacd4A2AKM2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hacd4A2AKM2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hacd4A2AKM2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Hacd4A2AKM2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hacd4A2AKM2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hacd4A2AKM2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hacd4A2AKM2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hacd4A2AKM2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hacd4A2AKM2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hacd4A2AKM2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hacd4A2AKM2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hacd4A2AKM2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hacd4A2AKM2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hacd4A2AKM2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hacd4A2AKM2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hacd4A2AKM2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hacd4A2AKM2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hacd4A2AKM2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hacd4A2AKM2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hacd4A2AKM2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hacd4A2AKM2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms